More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2332 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  99.74 
 
 
379 aa  776    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  99.74 
 
 
379 aa  776    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  99.22 
 
 
386 aa  789    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  99.74 
 
 
379 aa  776    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  99.74 
 
 
386 aa  791    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  99.47 
 
 
379 aa  774    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  100 
 
 
386 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  99.74 
 
 
379 aa  776    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  75.4 
 
 
378 aa  614  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  70.56 
 
 
379 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  66.93 
 
 
378 aa  554  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  67.72 
 
 
378 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  68.52 
 
 
378 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  66.4 
 
 
378 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  64.12 
 
 
379 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  64.12 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  64.12 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  64.12 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  64.12 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  64.12 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  64.12 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  64.12 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  64.12 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  62.8 
 
 
379 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  62.8 
 
 
379 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  64.85 
 
 
377 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  65.24 
 
 
351 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  65.61 
 
 
348 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  65.61 
 
 
348 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  58.5 
 
 
373 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  64.19 
 
 
317 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  45.92 
 
 
386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  46.35 
 
 
376 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  42.5 
 
 
375 aa  305  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  43.82 
 
 
374 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  39.78 
 
 
368 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  39.78 
 
 
368 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  39.51 
 
 
368 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  41.08 
 
 
431 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  41.29 
 
 
371 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  35.32 
 
 
392 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  37.31 
 
 
396 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  38.75 
 
 
379 aa  245  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  36.29 
 
 
387 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  36.29 
 
 
387 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  34.91 
 
 
397 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  37.67 
 
 
396 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  34.83 
 
 
392 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  37.67 
 
 
391 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  37.67 
 
 
391 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  34.83 
 
 
392 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  34.83 
 
 
392 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  36.97 
 
 
393 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  38.44 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  41.49 
 
 
356 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  37.77 
 
 
381 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  41.61 
 
 
360 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  34.45 
 
 
393 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  35.11 
 
 
407 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  38.46 
 
 
391 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  37.99 
 
 
379 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  37.64 
 
 
391 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  34.92 
 
 
407 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  41.4 
 
 
385 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  34.88 
 
 
379 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  37.95 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  35.18 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  37.33 
 
 
362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  40.85 
 
 
446 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  40.85 
 
 
400 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  40.85 
 
 
422 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  38.81 
 
 
352 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
390 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.93 
 
 
396 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  34.6 
 
 
379 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  35.61 
 
 
350 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  34.69 
 
 
390 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  35.83 
 
 
372 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  34.35 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  33.42 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  33.62 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  37.04 
 
 
391 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  33.42 
 
 
426 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  35.9 
 
 
389 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  40.49 
 
 
387 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  32.41 
 
 
417 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3450  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.57 
 
 
364 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.1 
 
 
429 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.77 
 
 
429 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.77 
 
 
429 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.1 
 
 
429 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.1 
 
 
429 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.1 
 
 
429 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.77 
 
 
429 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  32.16 
 
 
423 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  32.16 
 
 
423 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  32.51 
 
 
383 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  32.36 
 
 
385 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  37.74 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  32.28 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>