212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2242 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  99.05 
 
 
317 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  99.05 
 
 
317 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
317 aa  645    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  99.37 
 
 
317 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  99.68 
 
 
317 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  98.11 
 
 
317 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  98.11 
 
 
317 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  97.79 
 
 
317 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  82.97 
 
 
317 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  82.97 
 
 
317 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  82.97 
 
 
317 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  82.97 
 
 
317 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  82.65 
 
 
317 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  70.35 
 
 
317 aa  457  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  60.92 
 
 
326 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  60.92 
 
 
326 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  57.81 
 
 
319 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  56.92 
 
 
317 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  54.06 
 
 
318 aa  339  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  48.6 
 
 
309 aa  305  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  57.66 
 
 
248 aa  278  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  41.46 
 
 
312 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  36.39 
 
 
300 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  36.71 
 
 
311 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  35.11 
 
 
302 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  47.64 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  34.69 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  44.95 
 
 
412 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  43.92 
 
 
404 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  45.77 
 
 
410 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  30.97 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  30.7 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  40 
 
 
403 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  38.71 
 
 
411 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  38.71 
 
 
411 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  38.71 
 
 
411 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  39.36 
 
 
410 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  29.56 
 
 
319 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  29.56 
 
 
319 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  32.26 
 
 
305 aa  129  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  38.3 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  38.3 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  38.3 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  38.3 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  38.3 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  38.3 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  38.3 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  37.81 
 
 
406 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  29.28 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  37.63 
 
 
411 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  36.14 
 
 
413 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  36.14 
 
 
413 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  38.71 
 
 
413 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  32.8 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  36.24 
 
 
404 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  34.38 
 
 
416 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  32.37 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  32.37 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  35.68 
 
 
439 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 
400 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  33.87 
 
 
407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  33.68 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  29.02 
 
 
298 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
407 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  33.33 
 
 
400 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  32.45 
 
 
400 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  27.53 
 
 
299 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  32.99 
 
 
562 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 
396 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
411 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  28.95 
 
 
297 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
411 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  30.58 
 
 
292 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  33.68 
 
 
521 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  32.26 
 
 
408 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  31.3 
 
 
302 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  31.82 
 
 
420 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  26.9 
 
 
305 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  29.75 
 
 
401 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  27.3 
 
 
304 aa  99.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
400 aa  99  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  30.57 
 
 
410 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  26.43 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  26.52 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  29.39 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  27.63 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  27.99 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  34.01 
 
 
396 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
400 aa  93.2  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  36.73 
 
 
401 aa  93.2  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  33.7 
 
 
396 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  26.82 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  27.04 
 
 
341 aa  92.8  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 
402 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 
402 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
403 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
403 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  25.31 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  25.63 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>