209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2101 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  99.53 
 
 		 427 aa  869    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  98.59 
 
 		 427 aa  863    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  85.71 
 
 		 427 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  85.71 
 
 		 427 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  98.59 
 
 		 427 aa  864    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  99.53 
 
 		 427 aa  869    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  85.48 
 
 		 427 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  85.71 
 
 		 427 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  98.59 
 
 		 427 aa  863    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  99.3 
 
 		 427 aa  867    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  99.06 
 
 		 427 aa  866    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  85.48 
 
 		 427 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  82.67 
 
 		 427 aa  747    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  97.82 
 
 		 412 aa  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  100 
 
 		 427 aa  872    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  65.78 
 
 		 415 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  65.78 
 
 		 450 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  65.54 
 
 		 450 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  66.16 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  63.5 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  66.51 
 
 		 416 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  62.92 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  64.18 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  42.89 
 
 		 417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  37.16 
 
 		 408 aa  252  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  36.8 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  37.56 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  39.43 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  29.83 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  30.15 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  30.77 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  29.6 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  28.96 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  29.29 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  30.1 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  31.66 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  30.93 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  26.3 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  27.92 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  27.34 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  29.46 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  29.46 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  29.46 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  29.46 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  28.47 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  28.47 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  29.46 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  28.14 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  26.62 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  27.83 
 
 		 464 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  36.06 
 
 		 212 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  27.68 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  26.96 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  27.74 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  29.22 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  29.22 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  29.22 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  29.22 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  150  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  43.43 
 
 		 205 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  44.1 
 
 		 205 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  44.1 
 
 		 205 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  29.38 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  40.98 
 
 		 213 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  27.83 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  26.18 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2222  paraquat-inducible protein A  37.44 
 
 		 207 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00958061  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  28.47 
 
 		 417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  44.56 
 
 		 210 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1797  paraquat-inducible protein A  41.67 
 
 		 210 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0702887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  41.26 
 
 		 213 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  39.41 
 
 		 216 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  27.48 
 
 		 380 aa  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  41.41 
 
 		 205 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  41.41 
 
 		 205 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  41.41 
 
 		 205 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  29.58 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  41.41 
 
 		 205 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  40.87 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  37.75 
 
 		 212 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  39.51 
 
 		 208 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2488  paraquat-inducible protein A  42.94 
 
 		 213 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0028453  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  38.73 
 
 		 206 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  40.39 
 
 		 209 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  38.73 
 
 		 206 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  27.67 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  29.35 
 
 		 401 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  39.52 
 
 		 249 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  38.5 
 
 		 207 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  36.27 
 
 		 206 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  39 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  39.25 
 
 		 213 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  41.99 
 
 		 245 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>