More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1899 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 303 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 303 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  99.67 
 
 		 303 aa  634    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  99.34 
 
 		 303 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  98.68 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  98.68 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  99.01 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  81.16 
 
 		 296 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  81.16 
 
 		 296 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  81.16 
 
 		 296 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1486  AraC family transcriptional regulator  80.14 
 
 		 296 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.012343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  67.8 
 
 		 303 aa  434  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1988  AraC family transcriptional regulator  81.67 
 
 		 194 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  hitchhiker  0.00402915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  27.38 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  27.34 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  26.86 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  39.58 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 530 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 204 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 168 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  21.88 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  30.28 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 1201 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  28.35 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 525 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 532 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 533 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.38 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  21.12 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  28.95 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.4 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.4 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.4 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>