154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1740 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  97.87 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.04 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  35.56 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.78 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.48 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.7 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.38 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.78 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.9 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  36.49 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.49 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  38.24 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.26 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 350 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.9 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.67 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  34.67 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  36.59 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.78 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  35 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.35 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.35 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.9 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.14 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.49 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  32.1 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.49 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.88 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.58 
 
 		 376 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  32.56 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.34 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  31.51 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.03 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.94 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  35.62 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.94 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.94 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.49 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.86 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  36.99 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  35.62 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.87 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0937778  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  34.88 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  36.99 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  36.99 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  36.99 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.67 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  36.99 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.99 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.67 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.51 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  32 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  36.99 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.61 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  34.21 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  31.33 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.85 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.08 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.44 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.75 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  39.66 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2554  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.25 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276945  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.49 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.03 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.08 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0929  putative antidote protein  35.29 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.56 
 
 		 361 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.88 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.08 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.21 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.59 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3561  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.89 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.43 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.1 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.17 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.67 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>