More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1632 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  99.5 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  99.5 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  99.5 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  99.5 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  5.99695e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  99 
 
 
201 aa  404  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  99 
 
 
201 aa  404  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  99.5 
 
 
201 aa  406  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  90.05 
 
 
201 aa  374  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  87.56 
 
 
201 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  87.56 
 
 
201 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  87.56 
 
 
201 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  87.56 
 
 
201 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  87.06 
 
 
201 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  82.09 
 
 
201 aa  344  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  81.59 
 
 
201 aa  341  3e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  81.59 
 
 
201 aa  341  3e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  81.59 
 
 
201 aa  341  3e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  78.61 
 
 
201 aa  329  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  75.12 
 
 
201 aa  320  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  76.12 
 
 
201 aa  319  2e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  73.13 
 
 
201 aa  316  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  68.66 
 
 
232 aa  287  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  59.5 
 
 
197 aa  252  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  61.5 
 
 
197 aa  251  4e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.8989e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  64.32 
 
 
198 aa  247  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  59 
 
 
197 aa  245  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  9.50602e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  60.8 
 
 
198 aa  243  1e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  60.8 
 
 
198 aa  243  1e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  60.8 
 
 
198 aa  243  2e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  63.02 
 
 
196 aa  240  8e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  60.2 
 
 
198 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.59762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  60.2 
 
 
198 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  59.6 
 
 
197 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  60.2 
 
 
198 aa  238  3e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.41081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  59.7 
 
 
198 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.73737e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  60.1 
 
 
194 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  59.2 
 
 
198 aa  234  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  58.59 
 
 
213 aa  232  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  54.89 
 
 
206 aa  201  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2923  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.5 
 
 
199 aa  197  1e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660673  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  48.99 
 
 
199 aa  194  5e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.48 
 
 
204 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.48 
 
 
199 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.48 
 
 
199 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.48 
 
 
199 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  48.74 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  48.74 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  48.74 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  48.74 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  48.74 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.98 
 
 
198 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.98 
 
 
198 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50.27 
 
 
198 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.47 
 
 
198 aa  189  3e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 
199 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.66 
 
 
198 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49.73 
 
 
198 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.73 
 
 
198 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.73 
 
 
198 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.66 
 
 
198 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  48.66 
 
 
198 aa  183  1e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  47.47 
 
 
199 aa  183  2e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  48.7 
 
 
213 aa  181  8e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.9212e-06  hitchhiker  7.0742e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  48.7 
 
 
213 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
198 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  44.72 
 
 
199 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.26863e-05  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.11 
 
 
209 aa  174  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.99 
 
 
198 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.99 
 
 
198 aa  174  1e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4167  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.28 
 
 
208 aa  171  6e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.78 
 
 
199 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.65 
 
 
204 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.16 
 
 
204 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.1 
 
 
197 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.07 
 
 
202 aa  155  5e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.9255e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.14 
 
 
232 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.14 
 
 
232 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.2 
 
 
204 aa  152  3e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  45.3 
 
 
202 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  45.99 
 
 
208 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  45.05 
 
 
202 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.11 
 
 
208 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.11 
 
 
208 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  47.25 
 
 
203 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  47.25 
 
 
203 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.69 
 
 
207 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  42.78 
 
 
203 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.23 
 
 
214 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.23 
 
 
214 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.48 
 
 
216 aa  147  1e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.86 
 
 
217 aa  147  1e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.16 
 
 
232 aa  146  2e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  46.77 
 
 
203 aa  146  2e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.12 
 
 
207 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.37 
 
 
200 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  1.14134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.78 
 
 
209 aa  145  4e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.41 
 
 
207 aa  145  4e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  46.7 
 
 
203 aa  145  4e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>