46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1558 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  100 
 
 
262 aa  539  1e-152  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  99.62 
 
 
262 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  99.62 
 
 
262 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  99.62 
 
 
262 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  99.62 
 
 
262 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  99.17 
 
 
242 aa  494  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  99.59 
 
 
242 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  99.17 
 
 
242 aa  493  1e-138  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  98.35 
 
 
242 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  91.32 
 
 
242 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  91.32 
 
 
242 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  90.91 
 
 
242 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  90.91 
 
 
242 aa  460  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  90.91 
 
 
242 aa  460  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  84.32 
 
 
237 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  72.1 
 
 
235 aa  354  7e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  70.51 
 
 
239 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  70.56 
 
 
256 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  70.09 
 
 
239 aa  339  3e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  70.56 
 
 
256 aa  337  1e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  68.12 
 
 
243 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  66.52 
 
 
249 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  56.52 
 
 
236 aa  262  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  56.09 
 
 
248 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.37 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.59 
 
 
424 aa  72.8  5e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.04 
 
 
304 aa  70.5  2e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.01 
 
 
315 aa  66.6  4e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.41 
 
 
218 aa  66.2  5e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  32.28 
 
 
514 aa  62  9e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.57 
 
 
406 aa  50.8  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.11 
 
 
618 aa  49.7  4e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.23 
 
 
606 aa  49.3  7e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.23 
 
 
606 aa  49.3  7e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.8 
 
 
500 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.37 
 
 
506 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5276  hypothetical protein  30.46 
 
 
437 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.23 
 
 
379 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.88 
 
 
453 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  25.35 
 
 
351 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.05 
 
 
1034 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.63 
 
 
432 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.35 
 
 
386 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.46 
 
 
615 aa  42  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.15 
 
 
344 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>