26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1441 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



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Replicon accession

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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1441  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 
126 aa  255  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3154  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  95.9 
 
 
124 aa  238  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000295998  hitchhiker  0.0000000000179448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1845  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  95.9 
 
 
124 aa  238  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000255271  hitchhiker  0.00000000107565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1260  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  90.16 
 
 
124 aa  228  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000987444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1764  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  93.16 
 
 
119 aa  221  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387819  hitchhiker  0.00606421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1159  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  94.78 
 
 
123 aa  219  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.52129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  93.04 
 
 
121 aa  218  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00142112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1175  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  90.43 
 
 
121 aa  214  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000177122  hitchhiker  0.000000000000201219 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1435  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  93.75 
 
 
119 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2799  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  93.69 
 
 
119 aa  210  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.629369  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  91.07 
 
 
119 aa  206  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565025  hitchhiker  0.0000000001404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1523  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  96.2 
 
 
85 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0300  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  60.91 
 
 
120 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00505  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.320878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00500  endonuclease RUS  40 
 
 
120 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.377255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3222  endodeoxyribonuclease RUS  40.91 
 
 
120 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298592  hitchhiker  0.00412793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1609  endodeoxyribonuclease RUS  38.18 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4449  bacteriophage V crossover junction endodeoxyribonuclease  39.06 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00181578  unclonable  0.00000000115544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0821  endodeoxyribonuclease RUS  39.09 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2155  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  38.98 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259574  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2281  holiday-junction resolvase  46.39 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.328249  hitchhiker  1.35608e-22 
 
 
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NC_014214  Mesil_3595  endodeoxyribonuclease RusA  35.63 
 
 
120 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0872  endodeoxyribonuclease RusA  28.57 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1129  endodeoxyribonuclease RusA  32.63 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00235578  normal 
 
 
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NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  31.18 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2324  endodeoxyribonuclease RusA  26.03 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal 
 
 
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