39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1433 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  100 
 
 		 320 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  98.64 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  90.94 
 
 		 315 aa  577  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  57.27 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  57.79 
 
 		 339 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  57.79 
 
 		 321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  57.79 
 
 		 304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  60.3 
 
 		 321 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  66.67 
 
 		 80 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  67.09 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  28.88 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  26.26 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1014  phage replication protein O domain-containing protein  41.44 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  unclonable  0.00000357424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  34.78 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  34.78 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  38.66 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  38.66 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  38.66 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  29.1 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  39.33 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  40.78 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1152  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.303869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  25.64 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  27.06 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  46.48 
 
 		 86 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  25.35 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  24.32 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  38.89 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  38.89 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  38.89 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  38.89 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  39.19 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  24.32 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  28.47 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  25.62 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  25.62 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  39.13 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  27.27 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1831  hypothetical protein  25 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0214097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>