34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1198 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  100 
 
 		 361 aa  748    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  47.37 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  47.37 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  46.96 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  46.96 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  46.81 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  45.48 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  45.48 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  39.4 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  37.98 
 
 		 377 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  36.97 
 
 		 843 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  36.36 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  37.99 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  35.38 
 
 		 695 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  37.09 
 
 		 1082 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  36.91 
 
 		 955 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 		 882 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  36.64 
 
 		 363 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  35.26 
 
 		 1077 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  35.36 
 
 		 1247 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  37.85 
 
 		 787 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  38.04 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  34.53 
 
 		 686 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.25 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  36.36 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.8 
 
 		 957 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.73 
 
 		 734 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.69 
 
 		 357 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.17 
 
 		 734 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.78 
 
 		 751 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  34.78 
 
 		 751 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  30.93 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  21.28 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  21.28 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>