151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1186 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  98.78 
 
 		 492 aa  963    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  98.98 
 
 		 492 aa  964    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  85.16 
 
 		 510 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  85.37 
 
 		 510 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  85.37 
 
 		 510 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  98.78 
 
 		 492 aa  963    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  91.26 
 
 		 492 aa  902    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  85.37 
 
 		 503 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  98.58 
 
 		 492 aa  965    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  99.39 
 
 		 492 aa  968    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  99.39 
 
 		 492 aa  970    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  99.19 
 
 		 492 aa  964    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  100 
 
 		 492 aa  974    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  85.16 
 
 		 510 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  35.07 
 
 		 483 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  31.28 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 477 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.59 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.12 
 
 		 504 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  26.13 
 
 		 501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 503 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 		 479 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 475 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.97 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  23.48 
 
 		 510 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 510 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  23.56 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 500 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  24.62 
 
 		 504 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 508 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 484 aa  116  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.12 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.29 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 490 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 499 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  23.52 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.09 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 575 aa  106  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.56 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.56 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 482 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 507 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 		 520 aa  98.2  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 490 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 		 508 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 482 aa  94  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 484 aa  93.2  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.6 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  22.07 
 
 		 512 aa  91.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.94 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 488 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 421 aa  90.5  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  22.45 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 514 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 494 aa  87  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  19.69 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>