133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0830 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  99.24 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  99.24 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  99.24 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  99.24 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  98.48 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  99.24 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  99.24 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  98.48 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  85.61 
 
 		 132 aa  236  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  90.91 
 
 		 132 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  90.91 
 
 		 132 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  90.91 
 
 		 132 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  90.91 
 
 		 132 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  90.91 
 
 		 132 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  63.64 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  63.64 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  63.64 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  63.28 
 
 		 135 aa  169  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  59.09 
 
 		 135 aa  167  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  59.85 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  61.76 
 
 		 138 aa  166  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  62.9 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  58.02 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  65.62 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  49.5 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  44.23 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  43.27 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  46.43 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  41.11 
 
 		 248 aa  74.3  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  35.2 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  34.51 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  33.06 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  38.32 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  28.7 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  31.97 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  32.08 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  32.08 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  32.08 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  35.51 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  31.68 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  30.4 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  30.39 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2908  LrgA family protein  37.61 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  29.6 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  32.17 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  36.08 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  38.27 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  31.73 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  28.8 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  28.7 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  38.54 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  28.7 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  28 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  28.7 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  28 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  27.83 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  27.83 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  27.83 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  27.83 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  45.16 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  32.71 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  30 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  26.96 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1346  LrgA family protein  43.04 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.749748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  25.81 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  32.26 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  28 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  27.43 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  25.81 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3957  murein hydrolase regulator LrgA  28.07 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0184  hypothetical protein  32.18 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  27.18 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  28.85 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  29.35 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  33.65 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  25 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  31.07 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5233  murein hydrolase regulator LrgA  25.86 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  35.78 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  32.98 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  35 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  26.85 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  34.15 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  35.71 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  31.13 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  25.97 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  36 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  32.56 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  26.32 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  28.43 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  30.67 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  25.2 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>