163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0724 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  90.26 
 
 		 367 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  94.15 
 
 		 367 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  96.01 
 
 		 368 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  92.82 
 
 		 363 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  99.2 
 
 		 376 aa  743    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  88.33 
 
 		 364 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  100 
 
 		 376 aa  748    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02101  hypothetical protein  88.89 
 
 		 329 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  78.24 
 
 		 378 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  78.24 
 
 		 378 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  78.24 
 
 		 378 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  78.24 
 
 		 378 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  78.24 
 
 		 378 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  76.3 
 
 		 372 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02142  outer membrane porin protein C  88.89 
 
 		 311 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  69.19 
 
 		 370 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  67.87 
 
 		 371 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  67.87 
 
 		 371 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  67.87 
 
 		 371 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  65.73 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  65.47 
 
 		 383 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  65.47 
 
 		 383 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01348  outer membrane pore protein N, non-specific  66.84 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2269  porin Gram-negative type  66.58 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.421789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  65.47 
 
 		 388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  66.84 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  66.84 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  66.84 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  66.84 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1614  outer membrane protein N  66.84 
 
 		 377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.51983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  62.66 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  66.32 
 
 		 380 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  62.14 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  62.43 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  62.14 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  62.14 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  65.63 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  64.16 
 
 		 369 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  60.68 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  60.96 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  61.54 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1776  outer membrane protein N  65.19 
 
 		 372 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  61.88 
 
 		 398 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  62.69 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  61.88 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  60.93 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  57.65 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  57.91 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  57.91 
 
 		 371 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  58.12 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  57.52 
 
 		 350 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  58.38 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  61.37 
 
 		 372 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  56.32 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  60.82 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  60.82 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  56.32 
 
 		 351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  60.82 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  60.82 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  56.32 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  56.32 
 
 		 351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  56.32 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  55.75 
 
 		 365 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  56.05 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  58.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  58.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  58.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  58.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  58.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  59.64 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  59.64 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  55.79 
 
 		 351 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  58.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  56.3 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  56.3 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1589  outer membrane porin protein LC  61.38 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.810656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  57.58 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  57.58 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  58.33 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  57.4 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  55.26 
 
 		 350 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  55.26 
 
 		 350 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  55 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  55.26 
 
 		 350 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  55.26 
 
 		 350 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  56.74 
 
 		 373 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  58.33 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  55.12 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  54.59 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  52.07 
 
 		 363 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  52.07 
 
 		 363 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  52.07 
 
 		 363 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  52.07 
 
 		 363 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  52.07 
 
 		 363 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  51.27 
 
 		 368 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  50.66 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  50.66 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  50.66 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2056  porin Gram-negative type  47.53 
 
 		 368 aa  301  9e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1666  porin Gram-negative type  47.67 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000017605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>