20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0694 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0694  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1256  hypothetical protein  93.88 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000872086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2212  hypothetical protein  93.88 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000176399  hitchhiker  4.9306e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1507  hypothetical protein  91.84 
 
 		 76 aa  100  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.915336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1430  hypothetical protein  91.84 
 
 		 77 aa  98.6  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000021461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1421  hypothetical protein  87.76 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000075618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01540  conserved hypothetical protein  91.84 
 
 		 68 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0151809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1779  hypothetical protein  89.8 
 
 		 51 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.978662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3171  hypothetical protein  89.8 
 
 		 51 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000407822  decreased coverage  6.63336e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1828  hypothetical protein  89.8 
 
 		 51 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  hitchhiker  0.0000000000000243286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2289  protein of unknown function DUF1391  89.8 
 
 		 51 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01342  hypothetical protein  89.8 
 
 		 51 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.369437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01332  predicted protein  89.8 
 
 		 51 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2072  protein of unknown function DUF1391  89.8 
 
 		 51 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0268089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2057  hypothetical protein  89.8 
 
 		 51 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1158  hypothetical protein  85.71 
 
 		 51 aa  94  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405262  hitchhiker  5.1673899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2811  hypothetical protein  85.42 
 
 		 50 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01532  hypothetical protein  97.37 
 
 		 38 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010302  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4948  hypothetical protein  67.39 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.569316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1650  hypothetical protein  85.29 
 
 		 36 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>