More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0672 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  99.04 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  99.04 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  98.72 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  99.04 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  99.04 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  98.72 
 
 		 313 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  98.72 
 
 		 313 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  85.26 
 
 		 312 aa  517  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  84.94 
 
 		 312 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  85.26 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  84.94 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  85.26 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  78.55 
 
 		 312 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  66.55 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  66.55 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  66.22 
 
 		 312 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  64.86 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  68.71 
 
 		 316 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  67.31 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  48.43 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  46.92 
 
 		 299 aa  252  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  46.92 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  46.8 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  47.42 
 
 		 325 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  45.24 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  45.31 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  46.58 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  46.92 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  46.58 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  46.58 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  42.29 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  45.89 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  45.89 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  45.89 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  43 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  41.26 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  41.05 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  43.79 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.45 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  43.51 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  42.57 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  42.5 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  43.19 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.67 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  42.71 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  42.71 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.09 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.09 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 300 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  39.8 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  39.53 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 398 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  39.2 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  38.29 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 316 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  40.4 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40.53 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.04 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  39.19 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  39.41 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  39.41 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  39.78 
 
 		 313 aa  185  7e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  38.94 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  41.9 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  38.23 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  38.23 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.94 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>