179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0420 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  100 
 
 		 310 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  98.39 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  98.39 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  98.39 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  98.71 
 
 		 310 aa  627  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  98.71 
 
 		 310 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  98.71 
 
 		 310 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  98.39 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  98.71 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  72.04 
 
 		 310 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  63.61 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  50.66 
 
 		 313 aa  323  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  47.68 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  45.07 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  43.75 
 
 		 332 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  44.22 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  43.65 
 
 		 624 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  42.16 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  42.16 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  42.16 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  40.98 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  43.89 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  42.48 
 
 		 624 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  43 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  43.43 
 
 		 601 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  40.2 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  41.5 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  40.82 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  39.74 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  40.59 
 
 		 608 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  41.31 
 
 		 425 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  41.26 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  42.46 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  39.23 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  39.23 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  39.23 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  39.23 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  39.23 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  39.23 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  39.23 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  39.23 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  41.46 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  38.91 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  39.72 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  39.72 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  37.38 
 
 		 343 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  39.79 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  39.79 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  38.94 
 
 		 613 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  38.91 
 
 		 309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  38.59 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  41.16 
 
 		 483 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  36.84 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  41.64 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  38.54 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  38.11 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  38.11 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  38.11 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  36.27 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  37.67 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  38.25 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  38.25 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  39.86 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  36.42 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  41.46 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  42.51 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  37.29 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  38.11 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  38.11 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  37.46 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  40.66 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  37.5 
 
 		 418 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  37.46 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  36.09 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  37.29 
 
 		 620 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  38.81 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  37.76 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  41.81 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  40.77 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  36.09 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  41.46 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  41.11 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  37.13 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  39.67 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  37.13 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  37.13 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  37.13 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  41.11 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  40 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  39.02 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  41.11 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  38.64 
 
 		 318 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>