68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0064 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  90.56 
 
 		 392 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  91.33 
 
 		 392 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  90.31 
 
 		 392 aa  695    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  90.31 
 
 		 392 aa  695    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  91.07 
 
 		 392 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  100 
 
 		 360 aa  723    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  90.56 
 
 		 392 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  78.57 
 
 		 392 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  62.86 
 
 		 393 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  62.86 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  62.86 
 
 		 393 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  62.34 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  53.59 
 
 		 381 aa  358  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  48.4 
 
 		 409 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  47.94 
 
 		 392 aa  328  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  47.03 
 
 		 393 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  47.29 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  48.14 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  46.23 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  47.87 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  47.87 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  47.87 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  47.87 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  46.75 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  46.49 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  46.49 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  46.49 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  46.49 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  46.49 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  46.23 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  47.01 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  46.49 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  46.49 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  41.75 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  41.75 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  42.46 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  41.75 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  41.75 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  41.75 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  41.49 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  40.52 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  33.33 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  29.56 
 
 		 404 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  27.52 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  26.69 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 405 aa  99.4  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 431 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  43.61 
 
 		 160 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  27 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  27 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  24.3 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  27.27 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  29.41 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  25.69 
 
 		 445 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>