14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0038 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0038  description: insertion element; ORF5 protein  100 
 
 
46 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  82.22 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  77.78 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  80 
 
 
343 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  77.78 
 
 
72 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  77.78 
 
 
72 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2577  IS630 orf  60 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.093225  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  62.22 
 
 
345 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  62.22 
 
 
345 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  62.22 
 
 
345 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  60 
 
 
345 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  60 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  60 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  60 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>