53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0010 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0010  IS1 transposase orfA  100 
 
 
70 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4758  IS1 transposase orfA  98.57 
 
 
70 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.267122  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1892  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3788  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1064  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000575561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3510  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1672  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3481  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0752562  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3445  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1728  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.793501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3269  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3071  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0149774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3253  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1977  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.597329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1999  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.69101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2059  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.737234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2357  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000108555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2395  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3050  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4206  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4895  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4869  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.607865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4801  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4740  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.610496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4648  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4584  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.42041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4539  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0015  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0149145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0131  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000277959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0467  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0533  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0547  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4284  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0705  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.338956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0928  IS1 transposase orfA  98.41 
 
 
63 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1734  IS1 transposase orfA  96.83 
 
 
63 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.689186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0996  IS1 transposase orfA  98.39 
 
 
63 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000873368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3363  IS1 transposase orfA  96.83 
 
 
63 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0605  IS1 transposase orfA  96.83 
 
 
63 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3943  IS1 transposase orfA  96.83 
 
 
63 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1709  IS1 transposase orfA  93.65 
 
 
63 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1546  IS1 transposase orfA  98.31 
 
 
59 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0103  IS1 transposase orfA  78.57 
 
 
70 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00476408  hitchhiker  0.000118207 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0075  IS1 transposase orfA  78.57 
 
 
70 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2254  IS1 transposase orfA  75.71 
 
 
70 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.697186  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0069  IS1 transposase orfA  77.14 
 
 
70 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2995  IS1 transposase orfA  77.14 
 
 
70 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.210282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1029  IS1 transposase orfA  77.14 
 
 
70 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.836942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0556  IS1 transposase orfA  77.14 
 
 
70 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0163  IS1 transposase orfA  77.14 
 
 
70 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000446765  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0085  IS1 transposase orfA  77.14 
 
 
70 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162991  hitchhiker  0.0000000467836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1711  IS1 transposase orfA  100 
 
 
41 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0763  IS1 transposase orfA  97.5 
 
 
41 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>