More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_0008 on replicon NC_010657
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  100 
 
 		 219 aa  457  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  96.8 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  32.24 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  28.3 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  28.3 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  27.78 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  28.11 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  28.95 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  24.54 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  36.36 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.68 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.27 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.27 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  31.79 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.94 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  30.46 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  24.31 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.36 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.9 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.9 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.9 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.58 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.9 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.9 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.23 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.43 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.97 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.85 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.85 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.3 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.3 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.39 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  27.32 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  27.36 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  32.46 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.73 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  26.85 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.36 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.43 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.75 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  25.23 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  26.19 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.26 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  26.5 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.06 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.36 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  26.67 
 
 		 267 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  23.35 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0076  hypothetical protein  37.21 
 
 		 94 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0337639  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.06 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.06 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.85 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  25.68 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  23.2 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  26.61 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.11 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  24.34 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  24.69 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  32.47 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  26.29 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.1 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.88 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  25.15 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  28.93 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  25.84 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  26.04 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  25.69 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  22.18 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  26.39 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  26.39 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  26.39 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.77 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.04 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>