53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_0004 on replicon NC_010657
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0086  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  143  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.316924 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  143  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3052  hemolysin expression-modulating protein  68.75 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.029809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1008  hemolysin expression-modulating protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0085  hypothetical protein  63.64 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0005  hypothetical protein  63.64 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000926061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0940  hemolysin expression-modulating protein  64.62 
 
 		 72 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1118  hemolysin expression-modulating protein  64.62 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524587  unclonable  0.00000000811136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3246  hemolysin expression-modulating protein  65.62 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1065  hemolysin expression-modulating protein  65.62 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3073  hemolysin expression-modulating protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000183634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3034  hemolysin expression-modulating protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000595952  normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3214  hemolysin expression-modulating protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00381272  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0517  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000983246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0514  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000755855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0533  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.150441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0576  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0731512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0523  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0220013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3156  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 76 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3150  hemolysin expression modulating family protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483952  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0392  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0550  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655307  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00411  modulator of gene expression, with H-NS  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0536  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0503  hemolysin expression-modulating protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00416  hypothetical protein  61.54 
 
 		 72 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0277  hypothetical protein  61.54 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.298788  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0060  virulence modulating protein  56.72 
 
 		 68 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.158481  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0044  haemolysin expression modulating protein  50.75 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.122459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2134  haemolysin expression modulating protein  56.36 
 
 		 58 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0005  hypothetical protein  46.88 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4886  haemolysin expression modulating protein  60 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3334  haemolysin expression modulating protein  66.67 
 
 		 46 aa  62  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2990  hemolysin expression modulating family protein  45.71 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1559  oriC-binding nucleoid-associated protein  42.86 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000113197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1881  oriC-binding nucleoid-associated protein  42.86 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1713  oriC-binding nucleoid-associated protein  42.86 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.095821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1631  oriC-binding nucleoid-associated protein  42.86 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.102344  normal  0.455792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1571  oriC-binding nucleoid-associated protein  42.86 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2337  oriC-binding nucleoid-associated protein  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1814  oriC-binding nucleoid-associated protein  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01585  hypothetical protein  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1574  oriC-binding nucleoid-associated protein  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.209726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2004  oriC-binding nucleoid-associated protein  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000476482  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1833  oriC-binding nucleoid-associated protein  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1701  oriC-binding nucleoid-associated protein  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2016  hemolysin expression modulating family protein  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000509834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01595  predicted regulator  44.93 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0142757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1823  oriC-binding nucleoid-associated protein  43.48 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2326  oriC-binding nucleoid-associated protein  43.48 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2026  oriC-binding nucleoid-associated protein  43.48 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1915  oriC-binding nucleoid-associated protein  43.94 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2153  oriC-binding nucleoid-associated protein  42.42 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>