More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_R0054 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.755946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000878402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0065  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0065  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1510  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0040  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0507  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0352051  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0077  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.329264  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0035  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2257  tRNA-Ala  98.57 
 
 
78 bp  131  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2321  tRNA-Ala  98.57 
 
 
78 bp  131  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0053  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  98.57 
 
 
78 bp  131  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1725  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.67576  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.05 
 
 
79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.05 
 
 
79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.05 
 
 
79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.05 
 
 
79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.05 
 
 
79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.05 
 
 
79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.05 
 
 
79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5287  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.231328  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  96.05 
 
 
78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1464  tRNA-Ala  98.51 
 
 
73 bp  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0518  tRNA-Ala  98.51 
 
 
73 bp  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0461  tRNA-Ala  98.51 
 
 
73 bp  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.689398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5734  tRNA-Ala  95.95 
 
 
78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.95 
 
 
76 bp  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  95.95 
 
 
76 bp  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000396068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0787  tRNA-Ala  95.95 
 
 
78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3879199999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  95.95 
 
 
76 bp  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  95.95 
 
 
76 bp  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  95.95 
 
 
76 bp  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000494003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.95 
 
 
76 bp  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0862  tRNA-Ala  95.95 
 
 
78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5026  tRNA-Ala  95.95 
 
 
78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000587824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5811  tRNA-Ala  95.95 
 
 
78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0220  tRNA-Ala  95.95 
 
 
78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000245454  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  97.14 
 
 
76 bp  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  97.14 
 
 
76 bp  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  97.14 
 
 
76 bp  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4569  tRNA-Ala  95.95 
 
 
78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000675831  normal  0.111562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4995  tRNA-Ala  95.95 
 
 
78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5655  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000213498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0135  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>