More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_R0012 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.3664e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.585582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.11563e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.73646e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0612  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.21451e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0135  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.05897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0102  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.62923e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0090  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.19047e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.14384e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4999  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0783  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.77174e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0537  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.26138e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4765  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000105314  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.38303e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.94127e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0216  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.19569e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  6.50347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.2576e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0086  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.34948e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0022  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00428299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.4552e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  8.15905e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.60665e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4573  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.69223e-11  normal  0.110089 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00746864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.72811e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.99273e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  98.46 
 
 
75 bp  121  2e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  7.21816e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0174  tRNA-Gly  98.46 
 
 
75 bp  121  2e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5654  tRNA-Gly  98.46 
 
 
72 bp  121  2e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.15914e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  98.46 
 
 
72 bp  121  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  8.14589e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0195  tRNA-Gly  98.46 
 
 
75 bp  121  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5657  tRNA-Gly  98.46 
 
 
75 bp  121  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  7.92898e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0040  tRNA-Gly  98.46 
 
 
72 bp  121  2e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.10792e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  98.46 
 
 
75 bp  121  2e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.45849e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  98.46 
 
 
75 bp  121  2e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000301735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0040  tRNA-Gly  98.46 
 
 
72 bp  121  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.634702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5141  tRNA-Gly  98.46 
 
 
75 bp  121  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000127094  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0098  tRNA-Gly  95.83 
 
 
75 bp  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00020662  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  5.88237e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0078  tRNA-Gly  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  92.31 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  92.31 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  92.31 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  92.31 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  92.31 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.2711e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.81106e-05  hitchhiker  2.54958e-05 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  93.22 
 
 
72 bp  85.7  1e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  93.22 
 
 
72 bp  85.7  1e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  90.77 
 
 
72 bp  81.8  2e-14  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  90.77 
 
 
72 bp  81.8  2e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  90.77 
 
 
72 bp  81.8  2e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  3.36039e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  90.77 
 
 
72 bp  81.8  2e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  90.77 
 
 
72 bp  81.8  2e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  90.77 
 
 
72 bp  81.8  2e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  90.77 
 
 
72 bp  81.8  2e-14  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  90.77 
 
 
72 bp  81.8  2e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.20136e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0561  tRNA-Gly  91.53 
 
 
72 bp  77.8  3e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  93.88 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.88 
 
 
75 bp  73.8  5e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  93.75 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0041  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1222  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0686417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  97.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  91.07 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  97.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  91.07 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>