69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2747 on replicon NC_009477
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 
126 aa  245  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  100 
 
 
126 aa  245  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  95.24 
 
 
126 aa  229  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  100 
 
 
117 aa  228  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  61.16 
 
 
123 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  61.16 
 
 
123 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  61.16 
 
 
123 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  35.25 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  35.77 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  31.9 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  39.47 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  34.96 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  34.96 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  31.9 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  34.96 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  34.15 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  29.82 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  29.41 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  34.48 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  29.51 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  31.93 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  34.19 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  27.59 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  28.33 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  24.11 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  31.36 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  21.19 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  23.48 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  24.11 
 
 
140 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  30.7 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  23.89 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  23.68 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  23.73 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  46.39 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  27.68 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  33.33 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  21.85 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  21.55 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  19.47 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  22.47 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  27.19 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  23.81 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  24.3 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  24.58 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  23.08 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  22.12 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  25.42 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  22.22 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  21.62 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  25.32 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  21.31 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  19.51 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  22.88 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  25.32 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  30.36 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  23.16 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  18.03 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  24.27 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  24.27 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  23.66 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  20.17 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  18.42 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  24.3 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>