More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2727 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  100 
 
 		 66 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 66 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  80.95 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  80.95 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80.95 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.02 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  74.6 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7468  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1938  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199562  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.43 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  73.44 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2863  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104202  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  69.7 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.31 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  73.44 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  75 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.05 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  75 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  69.84 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03487  putative cold shock-like protein cspG  70.31 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  73.33 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  73.33 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  73.33 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  73.33 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.33 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  73.02 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  68.25 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  73.02 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  73.02 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  73.02 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  73.02 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  73.02 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  73.02 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  73.02 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1165  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.05 
 
 		 69 aa  93.6  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  73.33 
 
 		 65 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  73.33 
 
 		 65 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  73.02 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  73.33 
 
 		 65 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  69.84 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  93.2  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 68 aa  93.2  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.43 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 68 aa  93.2  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  93.2  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.33 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  73.02 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  65.67 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 65 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  71.43 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  71.43 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0778  cold shock proteins  65.15 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.33 
 
 		 65 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 66 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  65.15 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 		 83 aa  91.3  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.15 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 69 aa  91.3  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>