160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2615 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  35.75 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
205 aa  101  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  30.91 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  30.95 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  31.54 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  26.74 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  26.35 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  28.48 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  27.33 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  24.61 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  46.15 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  26.06 
 
 
204 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  42.11 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  26.34 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  20.32 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
202 aa  58.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  28.48 
 
 
181 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  23.08 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  28.26 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  22.75 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  42.11 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  57.14 
 
 
189 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
225 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  43.1 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  32.26 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
182 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  40 
 
 
201 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  27.36 
 
 
202 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  37.1 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  23.13 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  36.07 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>