114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2534 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  61.31 
 
 
638 aa  782    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  100 
 
 
651 aa  1326    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  100 
 
 
651 aa  1326    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  26.59 
 
 
632 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  26.27 
 
 
632 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  25.68 
 
 
650 aa  217  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.17 
 
 
691 aa  101  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  23.36 
 
 
700 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  23.36 
 
 
700 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.36 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.36 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.36 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.36 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.36 
 
 
696 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.36 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.36 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  21.94 
 
 
695 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.94 
 
 
695 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.85 
 
 
695 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  21.85 
 
 
695 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.7 
 
 
695 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.82 
 
 
737 aa  80.9  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.32 
 
 
746 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.85 
 
 
695 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.87 
 
 
730 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.92 
 
 
740 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  31.14 
 
 
534 aa  65.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.64 
 
 
806 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  27.49 
 
 
717 aa  63.9  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.79 
 
 
740 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.54 
 
 
746 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.01 
 
 
706 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24.8 
 
 
717 aa  61.6  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.01 
 
 
706 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.07 
 
 
764 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.07 
 
 
764 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  21 
 
 
706 aa  61.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.07 
 
 
764 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  26.29 
 
 
721 aa  60.8  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  27.01 
 
 
725 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  28.8 
 
 
731 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25 
 
 
719 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  24.49 
 
 
883 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26 
 
 
763 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  30 
 
 
758 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.87 
 
 
763 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.87 
 
 
763 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24 
 
 
851 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  28.73 
 
 
388 aa  56.6  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  24.6 
 
 
721 aa  55.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.65 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  30.29 
 
 
734 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  25.82 
 
 
712 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  24.44 
 
 
712 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.6 
 
 
763 aa  54.3  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  24.81 
 
 
711 aa  54.3  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  29.33 
 
 
758 aa  53.9  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  29.33 
 
 
758 aa  53.9  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  29.33 
 
 
758 aa  53.9  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  29.33 
 
 
758 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  29.33 
 
 
758 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  29.33 
 
 
758 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  29.33 
 
 
758 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  26.42 
 
 
712 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  28.86 
 
 
717 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  28.86 
 
 
717 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  28.86 
 
 
717 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  28.86 
 
 
717 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  28.86 
 
 
717 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  26.19 
 
 
371 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  32.48 
 
 
379 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  29.53 
 
 
720 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  29.33 
 
 
367 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  27.51 
 
 
364 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  21.48 
 
 
636 aa  51.2  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.6 
 
 
720 aa  50.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  28.19 
 
 
711 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  29.73 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  27.71 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  23.02 
 
 
655 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  23.12 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  28.06 
 
 
552 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  34.52 
 
 
358 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  31.93 
 
 
375 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  23.03 
 
 
357 aa  48.9  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  22.3 
 
 
359 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  28.19 
 
 
711 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.76 
 
 
708 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  26.85 
 
 
720 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  26.85 
 
 
720 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  26.85 
 
 
717 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  26.85 
 
 
720 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  26.85 
 
 
720 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  26.85 
 
 
720 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  26.85 
 
 
720 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  29.71 
 
 
372 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  26.85 
 
 
717 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  29.77 
 
 
367 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  26.11 
 
 
733 aa  47.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.67 
 
 
727 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>