73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2500 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  100 
 
 
512 aa  1016    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  100 
 
 
512 aa  1016    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  41.18 
 
 
511 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  38.19 
 
 
518 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  39.29 
 
 
512 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  37.62 
 
 
535 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  36.79 
 
 
519 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  38 
 
 
537 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  36.49 
 
 
519 aa  348  9e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  38.11 
 
 
515 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  37.38 
 
 
519 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  37.6 
 
 
535 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  37.99 
 
 
535 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  37.6 
 
 
535 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  37.4 
 
 
539 aa  343  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  39.5 
 
 
534 aa  342  7e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  36.74 
 
 
519 aa  342  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  37.12 
 
 
538 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.48 
 
 
508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  34.78 
 
 
520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  37.4 
 
 
540 aa  340  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  35.4 
 
 
518 aa  340  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  37.4 
 
 
540 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  37.4 
 
 
540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  37.6 
 
 
538 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  37.6 
 
 
511 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  36.68 
 
 
539 aa  334  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  37.14 
 
 
525 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  34.84 
 
 
512 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  37.62 
 
 
532 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  37.31 
 
 
530 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.39 
 
 
507 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  36.35 
 
 
534 aa  324  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  37.91 
 
 
516 aa  323  4e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
510 aa  323  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
508 aa  323  6e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
508 aa  323  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  35.55 
 
 
519 aa  323  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
510 aa  322  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.51 
 
 
508 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  35.51 
 
 
508 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  36.05 
 
 
529 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  35.51 
 
 
508 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  35.84 
 
 
528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  35.51 
 
 
508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.04 
 
 
505 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  34.39 
 
 
520 aa  319  7e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  34.51 
 
 
519 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  35.35 
 
 
519 aa  316  6e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  36.42 
 
 
522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  36.31 
 
 
519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  36.31 
 
 
519 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  32.95 
 
 
514 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  36.31 
 
 
519 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  34.13 
 
 
519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  35.26 
 
 
509 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  33.6 
 
 
506 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  33.53 
 
 
523 aa  276  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  32.26 
 
 
518 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  32.26 
 
 
518 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  30.82 
 
 
585 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  31.47 
 
 
552 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  32.53 
 
 
305 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  42.21 
 
 
263 aa  163  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1855  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter-like protein  34.43 
 
 
88 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  30.16 
 
 
240 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1908  putative transporter  20.93 
 
 
476 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3013  transporter  20.91 
 
 
476 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000189205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3322  putative transporter  21.15 
 
 
476 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.871023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3342  putative transporter  20.91 
 
 
476 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3328  transporter, putative  21.15 
 
 
476 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3369  transporter  21.59 
 
 
476 aa  43.5  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3123  transporter  21.59 
 
 
476 aa  43.5  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000866663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>