More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2477 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  85.96 
 
 
559 aa  911    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  100 
 
 
545 aa  1086    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  100 
 
 
545 aa  1086    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  52.99 
 
 
536 aa  591  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  54.51 
 
 
491 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  47.81 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  47.42 
 
 
528 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  46.73 
 
 
530 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  45.09 
 
 
543 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  46.05 
 
 
555 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  45.38 
 
 
576 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  45.38 
 
 
544 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  45.75 
 
 
517 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  46.14 
 
 
543 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  46.2 
 
 
530 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  44.81 
 
 
516 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  46.02 
 
 
533 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  46.02 
 
 
533 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  46.02 
 
 
533 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  46.02 
 
 
533 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  45.83 
 
 
533 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  45.83 
 
 
533 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  45.1 
 
 
532 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  45.83 
 
 
533 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  45.83 
 
 
533 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  44.9 
 
 
532 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  45.6 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  45.1 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 
532 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 
532 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 
532 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  40.2 
 
 
530 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  31.6 
 
 
541 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  35.07 
 
 
528 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 
543 aa  297  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  31.96 
 
 
529 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  32.34 
 
 
546 aa  290  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  32.43 
 
 
541 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  34.1 
 
 
521 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  32.42 
 
 
537 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  33.07 
 
 
525 aa  279  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  32.41 
 
 
537 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  31.24 
 
 
664 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  31.48 
 
 
541 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  33.14 
 
 
537 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  31.24 
 
 
666 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  32.16 
 
 
518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  32.63 
 
 
541 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  31.84 
 
 
541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 
541 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 
541 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.41 
 
 
521 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 
541 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  33.59 
 
 
522 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 
541 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 
541 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 
546 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  29.55 
 
 
560 aa  253  7e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  29.55 
 
 
560 aa  253  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  29.64 
 
 
642 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  29.87 
 
 
519 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  29.64 
 
 
642 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  30.21 
 
 
531 aa  245  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  32.65 
 
 
533 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
533 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  31.3 
 
 
528 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  31.3 
 
 
528 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  32.51 
 
 
535 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  31.68 
 
 
535 aa  230  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 
537 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  29.89 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 
539 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  29.59 
 
 
539 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  29.08 
 
 
518 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  25.61 
 
 
542 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  25.79 
 
 
542 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 
630 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 
539 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  27.49 
 
 
539 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  30.88 
 
 
616 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 
635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 
614 aa  189  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  29.6 
 
 
647 aa  187  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 
576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 
503 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 
539 aa  139  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 
488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  25 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.41 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.53 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.38 
 
 
467 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.17 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  25 
 
 
485 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.17 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.17 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.17 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>