More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2278 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
102 aa  207  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  5.23033e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
102 aa  207  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.04136e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
102 aa  207  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  8.60395e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  88.24 
 
 
102 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.37851e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 
102 aa  187  3e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  88.24 
 
 
102 aa  187  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  5.04345e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  88.24 
 
 
102 aa  187  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.02631e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  88.24 
 
 
102 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  88.24 
 
 
102 aa  187  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.26776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  88.24 
 
 
102 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.06915e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  88.24 
 
 
102 aa  187  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.60274e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 
102 aa  187  6e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  2.27261e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 
102 aa  187  6e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.24324e-10  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 
102 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.09715e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 
102 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  4.28723e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 
102 aa  184  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.77818e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 
102 aa  177  5e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  2.8025e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 
102 aa  177  5e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  4.42606e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  84.31 
 
 
102 aa  177  6e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.60608e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 
102 aa  176  8e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.72811e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 
102 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  6.10931e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  83 
 
 
103 aa  172  1e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.15165e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  81 
 
 
103 aa  172  1e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  83 
 
 
103 aa  171  2e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  9.45352e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 
102 aa  172  2e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  4.59643e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 
102 aa  171  4e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  4.76333e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 
102 aa  169  9e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  3.09802e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 
102 aa  169  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 
102 aa  168  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.38297e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 
102 aa  168  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  80.39 
 
 
102 aa  167  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.35097e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  77.45 
 
 
102 aa  166  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 
102 aa  166  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  76.47 
 
 
102 aa  166  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  76.47 
 
 
102 aa  166  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 
102 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  77.45 
 
 
102 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  77.45 
 
 
102 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 
102 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 
102 aa  165  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 
102 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 
102 aa  164  3e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 
102 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  75.49 
 
 
102 aa  163  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 
102 aa  161  2e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  72.28 
 
 
103 aa  161  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  5.21962e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  76.7 
 
 
103 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.49687e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  161  4e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.53979e-11  unclonable  7.22161e-29 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 
102 aa  160  5e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  158  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  74.51 
 
 
102 aa  157  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  6.77882e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  156  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  156  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  156  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  72.55 
 
 
102 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  155  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  154  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  9.40072e-10  hitchhiker  5.09949e-07 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  71.57 
 
 
102 aa  154  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  154  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 
101 aa  154  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  153  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  153  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  71.57 
 
 
102 aa  153  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4508  ribosomal protein S10  70.3 
 
 
101 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.815174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  68.63 
 
 
102 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  1.7716e-07  hitchhiker  1.88362e-09 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.60411e-05  hitchhiker  1.52054e-10 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl122  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  151  3e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  5.36997e-55  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
106 aa  151  3e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.31589e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.23252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1139  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  149  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  3.05109e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  149  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  2.92109e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3668  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
105 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.62952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  67.65 
 
 
107 aa  148  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  7.02102e-06 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  67.65 
 
 
103 aa  147  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.64723e-06  decreased coverage  9.47215e-06 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0697  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
102 aa  147  5e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
103 aa  145  1e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  145  2e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
103 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
105 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  144  4e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.274e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  144  4e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
103 aa  143  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1859e-21  hitchhiker  3.42143e-05 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 
101 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 
101 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.8248e-09  unclonable  9.40306e-08 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 
101 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>