More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2276 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  90.34 
 
 		 207 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  67.01 
 
 		 207 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  66.16 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 		 207 aa  272  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  62.32 
 
 		 207 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  262  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  59.9 
 
 		 207 aa  256  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  59.42 
 
 		 208 aa  254  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  57 
 
 		 207 aa  252  4.0000000000000004e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  56.8 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  54.37 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  54.85 
 
 		 206 aa  225  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  53.4 
 
 		 206 aa  222  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  50.49 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  53.17 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  49.77 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  50.97 
 
 		 208 aa  207  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  48.79 
 
 		 207 aa  206  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  53.14 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  50.97 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  50.24 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  48.22 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  47.83 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  50.49 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  49.5 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 206 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  49.03 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 207 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  43.44 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  46.86 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  46.61 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  49.49 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  48.77 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  47.87 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  46.6 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  48.06 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  48.56 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  48.06 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  48.98 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  46.86 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  48.4 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  48.4 
 
 		 223 aa  184  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  46.3 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  49.22 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  46.9 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  47.98 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  46.9 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  50 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  48.72 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  46.15 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  44.02 
 
 		 215 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  49.23 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  46 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  45.77 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  44.85 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  46.35 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  45.5 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  44.27 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  46.77 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  46.77 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  46.77 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  44.27 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  43.75 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  44 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  42.44 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  45.77 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  44.71 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>