24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2232 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  100 
 
 		 809 aa  1649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  100 
 
 		 809 aa  1649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  38.01 
 
 		 1072 aa  488  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  27.64 
 
 		 1131 aa  294  6e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  29.37 
 
 		 1003 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  29.5 
 
 		 985 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  30.75 
 
 		 791 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  26.66 
 
 		 793 aa  253  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  26.74 
 
 		 797 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  26.6 
 
 		 576 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  26.14 
 
 		 792 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  26.9 
 
 		 753 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  26.13 
 
 		 739 aa  204  4e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  29.29 
 
 		 618 aa  195  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  23.44 
 
 		 846 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  22.78 
 
 		 892 aa  150  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  23.55 
 
 		 700 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  21 
 
 		 718 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  21.76 
 
 		 533 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  20.86 
 
 		 929 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  26.64 
 
 		 636 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  21.7 
 
 		 693 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  25 
 
 		 656 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  24.55 
 
 		 750 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>