More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2149 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  87.35 
 
 
412 aa  749    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
412 aa  846    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
412 aa  846    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  73.3 
 
 
411 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  71.84 
 
 
412 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 
413 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  70.56 
 
 
413 aa  608  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  70.32 
 
 
413 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  70.32 
 
 
413 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  70.32 
 
 
413 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 
414 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 
414 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 
413 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 
413 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 
413 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 
414 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  70.9 
 
 
415 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  69.66 
 
 
418 aa  592  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  70.42 
 
 
417 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 
415 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 
415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 
415 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  67.64 
 
 
415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 
415 aa  577  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  67.15 
 
 
415 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  68.14 
 
 
413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  68.87 
 
 
410 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  68.87 
 
 
410 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  66.99 
 
 
412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 
412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 
416 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 
413 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  67.24 
 
 
413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  66.01 
 
 
416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  65.53 
 
 
412 aa  558  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 
414 aa  558  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  65.44 
 
 
413 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 
415 aa  558  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  65.1 
 
 
420 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  65.53 
 
 
412 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 
429 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 
431 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  64.16 
 
 
423 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 
423 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 
427 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 
422 aa  544  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 
415 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0075  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 
413 aa  543  1e-153  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  63.2 
 
 
423 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  63.2 
 
 
423 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
415 aa  539  9.999999999999999e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 
411 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  64.66 
 
 
422 aa  538  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 
424 aa  536  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 
412 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  63.05 
 
 
417 aa  532  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 
414 aa  532  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 
412 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
425 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
425 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
417 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 
414 aa  531  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
419 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
424 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 
425 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 
417 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  64.65 
 
 
413 aa  528  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 
420 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 
417 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 
419 aa  527  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl106  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 
412 aa  521  1e-147  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
427 aa  522  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
411 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  63.01 
 
 
427 aa  521  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  64.53 
 
 
412 aa  518  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 
417 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 
411 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 
427 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 
466 aa  518  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 
412 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
414 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 
416 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  63.01 
 
 
427 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 
412 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  62.96 
 
 
417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 
422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 
412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
421 aa  514  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 
417 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 
427 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 
414 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 
417 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
423 aa  513  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>