More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2127 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2127  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000805212  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2165  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.001129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  83.45 
 
 
290 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  53.7 
 
 
278 aa  301  8.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  33.9 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1223  60 kDa inner membrane insertion protein  33.61 
 
 
316 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.092902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  37.92 
 
 
252 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  32.86 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0588  OxaA-like protein precursor  37.45 
 
 
320 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000375081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  30.77 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.1 
 
 
249 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  34.66 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  33.71 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  32.8 
 
 
255 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  32.8 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  32.8 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  32.8 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  32.8 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  32.8 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0914  preprotein translocase subunit YidC  34.56 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  32.8 
 
 
255 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  33.6 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  32.67 
 
 
255 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1396  preprotein translocase subunit YidC  30.3 
 
 
327 aa  123  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000130434  hitchhiker  1.60248e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1608  OxaA-like protein precursor  33.48 
 
 
310 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000470187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  30.53 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  31.3 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  31.3 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  31.93 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  30.53 
 
 
269 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  31.9 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  30.89 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  30.89 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  30.89 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  33.88 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  30.49 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  30.49 
 
 
260 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  31.03 
 
 
260 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  35.86 
 
 
209 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  30.86 
 
 
278 aa  105  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  33.64 
 
 
542 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  28.14 
 
 
257 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  34.47 
 
 
553 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  32.55 
 
 
229 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  34.17 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  34.04 
 
 
583 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  32.16 
 
 
223 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  29.61 
 
 
219 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  28.57 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.05 
 
 
518 aa  93.2  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  28.1 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.63 
 
 
517 aa  92.4  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  32.26 
 
 
225 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  29.01 
 
 
628 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  36 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  27.67 
 
 
341 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  32.64 
 
 
514 aa  86.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.91 
 
 
526 aa  86.3  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  26.51 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  28.87 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.13 
 
 
541 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  30.43 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  31.58 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  31.79 
 
 
551 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.75 
 
 
533 aa  82.4  0.000000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  29.61 
 
 
540 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.09 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  28.96 
 
 
607 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 
566 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.64 
 
 
540 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  32.83 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  31 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  32.49 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  29 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  28.43 
 
 
531 aa  80.9  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.73 
 
 
532 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  24.19 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1038  60 kDa inner membrane insertion protein  30.97 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0516206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  29.67 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.91 
 
 
787 aa  80.5  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  28.68 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  33.66 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  32.49 
 
 
536 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.16 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  29.67 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  28.92 
 
 
562 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.19 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.64 
 
 
541 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.38 
 
 
628 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.19 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.19 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.5 
 
 
560 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  29.8 
 
 
536 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>