More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2107 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  100 
 
 
382 aa  799  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  100 
 
 
382 aa  799  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  70.16 
 
 
382 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  44.47 
 
 
387 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  42.55 
 
 
384 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  39.73 
 
 
389 aa  259  5e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  39.46 
 
 
389 aa  259  5e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  40.8 
 
 
375 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  40.05 
 
 
398 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  40.32 
 
 
367 aa  256  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  39.46 
 
 
389 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  40.46 
 
 
391 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  39.95 
 
 
391 aa  254  1e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  41.24 
 
 
367 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  40.05 
 
 
391 aa  252  8e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  40.05 
 
 
391 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  40.05 
 
 
391 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  39.8 
 
 
391 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  39.13 
 
 
373 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  40.05 
 
 
391 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  35.66 
 
 
376 aa  249  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  40.87 
 
 
373 aa  249  6e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  40.2 
 
 
392 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  39.8 
 
 
391 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  39.8 
 
 
391 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  38.69 
 
 
373 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  40.16 
 
 
366 aa  246  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  40.05 
 
 
408 aa  245  1e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  38.42 
 
 
373 aa  245  1e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  39.21 
 
 
390 aa  245  1e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  38.13 
 
 
380 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  38.77 
 
 
373 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  38.28 
 
 
389 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  39.83 
 
 
388 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.03 
 
 
370 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37.77 
 
 
391 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  39.52 
 
 
386 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  39.1 
 
 
386 aa  235  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  34.05 
 
 
390 aa  234  2e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  37.76 
 
 
390 aa  233  4e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37 
 
 
373 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.32 
 
 
369 aa  229  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  37.87 
 
 
380 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  37.01 
 
 
433 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.2 
 
 
364 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  35.71 
 
 
373 aa  217  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  34.32 
 
 
377 aa  215  1e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  40.69 
 
 
380 aa  214  2e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  35.31 
 
 
364 aa  214  3e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  36.51 
 
 
376 aa  213  4e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  34.73 
 
 
389 aa  213  5e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.7 
 
 
382 aa  213  6e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  33.33 
 
 
390 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  35.9 
 
 
379 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  35.79 
 
 
366 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  36.05 
 
 
384 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  36.1 
 
 
379 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  35.6 
 
 
851 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  34.65 
 
 
374 aa  206  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  37.27 
 
 
379 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  35.64 
 
 
365 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  34.25 
 
 
388 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  37.01 
 
 
379 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.42 
 
 
403 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  36 
 
 
388 aa  201  1e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  36.87 
 
 
380 aa  201  2e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.01 
 
 
395 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.65 
 
 
378 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  34.75 
 
 
395 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  33.51 
 
 
406 aa  198  2e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  36.03 
 
 
382 aa  197  2e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  34.2 
 
 
395 aa  198  2e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.68 
 
 
379 aa  197  2e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  34.48 
 
 
395 aa  197  2e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  32.62 
 
 
371 aa  197  4e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  33.77 
 
 
434 aa  196  4e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  34.69 
 
 
378 aa  196  5e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  33.07 
 
 
421 aa  196  5e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  33.96 
 
 
383 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  33.96 
 
 
383 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  33.96 
 
 
383 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  35.29 
 
 
387 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.69 
 
 
370 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.19 
 
 
395 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  32.08 
 
 
417 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  34.05 
 
 
386 aa  195  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  34.33 
 
 
365 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  31.73 
 
 
371 aa  194  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  33.96 
 
 
384 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  32.7 
 
 
376 aa  189  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0325  alanine racemase  32.11 
 
 
373 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  33.51 
 
 
410 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>