More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1759 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  70.61 
 
 		 1065 aa  1567    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  36.07 
 
 		 1145 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1065 aa  2191    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  40.58 
 
 		 1108 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  37.03 
 
 		 1092 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  40.28 
 
 		 1108 aa  749    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  40.4 
 
 		 1108 aa  751    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  40.4 
 
 		 1108 aa  751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  40.21 
 
 		 1108 aa  752    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  40.4 
 
 		 1108 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  40.6 
 
 		 1109 aa  749    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  38.13 
 
 		 1127 aa  669    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  38 
 
 		 1139 aa  671    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  35.56 
 
 		 1155 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  40.4 
 
 		 1108 aa  751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.92 
 
 		 1134 aa  685    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  35.89 
 
 		 1156 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.87 
 
 		 1115 aa  656    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  40.87 
 
 		 1110 aa  756    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  36.62 
 
 		 1145 aa  679    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  40.31 
 
 		 1104 aa  736    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  40.4 
 
 		 1108 aa  751    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  34.73 
 
 		 1181 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1065 aa  2191    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  36.95 
 
 		 1139 aa  653    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  40.11 
 
 		 1108 aa  749    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  35.77 
 
 		 1159 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.61 
 
 		 1112 aa  633  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  35.16 
 
 		 1075 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  36.09 
 
 		 1130 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  35.39 
 
 		 1225 aa  632  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  34.2 
 
 		 1186 aa  626  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  37.2 
 
 		 1190 aa  626  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  36.7 
 
 		 1148 aa  622  1e-177  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  37.48 
 
 		 1038 aa  623  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  35.13 
 
 		 1157 aa  622  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  34.83 
 
 		 1164 aa  621  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  33.87 
 
 		 1132 aa  618  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  35.56 
 
 		 1159 aa  612  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  34.23 
 
 		 1156 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  34.79 
 
 		 1155 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  34.14 
 
 		 1155 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  34.4 
 
 		 1173 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  33.42 
 
 		 1156 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  32.77 
 
 		 1174 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  35.73 
 
 		 1184 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  34.86 
 
 		 1175 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  34.17 
 
 		 1143 aa  594  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  33.36 
 
 		 1178 aa  594  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  34.98 
 
 		 1143 aa  595  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  34.68 
 
 		 1180 aa  592  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  35.48 
 
 		 1149 aa  587  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  33.78 
 
 		 1148 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  34.31 
 
 		 1148 aa  588  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  31.97 
 
 		 1168 aa  588  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  34.9 
 
 		 1158 aa  588  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  32.46 
 
 		 1159 aa  589  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  34.99 
 
 		 1170 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  33.77 
 
 		 1160 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.32 
 
 		 1122 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  34.86 
 
 		 1182 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  33.78 
 
 		 1173 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  32.84 
 
 		 1171 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  34.67 
 
 		 1170 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  34.1 
 
 		 1149 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  34.56 
 
 		 1151 aa  581  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  34.43 
 
 		 1179 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  32.96 
 
 		 1168 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  34.77 
 
 		 1168 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  32.35 
 
 		 1195 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  32.29 
 
 		 1176 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  34.36 
 
 		 1163 aa  573  1.0000000000000001e-162  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.83 
 
 		 1165 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.9 
 
 		 1170 aa  576  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1148 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  33.49 
 
 		 1165 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  33.76 
 
 		 1160 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7295  DNA polymerase III, alpha subunit  34.41 
 
 		 1158 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20831  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  33.67 
 
 		 1160 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  33.55 
 
 		 1165 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1151 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  33.58 
 
 		 1160 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  33.67 
 
 		 1160 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  33.48 
 
 		 1160 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  33.48 
 
 		 1160 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4284  DNA polymerase III subunit alpha  34.1 
 
 		 1150 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.166792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  32.55 
 
 		 1217 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1160 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0187  DNA polymerase III alpha subunit  35.85 
 
 		 1123 aa  567  1e-160  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  32.53 
 
 		 1172 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  32.38 
 
 		 1165 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  33.11 
 
 		 1174 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  34.19 
 
 		 1151 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  33.3 
 
 		 1210 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  34.29 
 
 		 1151 aa  569  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  32.1 
 
 		 1171 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  33.48 
 
 		 1160 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  33.37 
 
 		 1154 aa  569  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  32.73 
 
 		 1172 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  32.6 
 
 		 1179 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>