More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1688 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  84.96 
 
 
424 aa  760    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
420 aa  870    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
420 aa  870    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 
426 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 
423 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 
423 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 
423 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 
423 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 
423 aa  522  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 
423 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
423 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 
423 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 
423 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 
423 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
423 aa  521  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 
423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
419 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
423 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
418 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
419 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
425 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
420 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
426 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
421 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
424 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
415 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
415 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
421 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
436 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
426 aa  385  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
420 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
421 aa  379  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
423 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
419 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
429 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
435 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
433 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
429 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
429 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  45.11 
 
 
422 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
421 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
416 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
441 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
428 aa  365  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
430 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
419 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
423 aa  365  1e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
416 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
420 aa  363  4e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
414 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
420 aa  360  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
419 aa  359  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
413 aa  356  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
418 aa  355  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
414 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
429 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
429 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
429 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
429 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
429 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
418 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
418 aa  350  3e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
445 aa  349  5e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
413 aa  349  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
420 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
464 aa  346  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  41.09 
 
 
421 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
426 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
429 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
415 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
423 aa  343  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  42.58 
 
 
424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  42 
 
 
421 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
424 aa  342  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
422 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
423 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
427 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
418 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
422 aa  341  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  41.75 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
426 aa  340  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
424 aa  339  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
424 aa  339  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
429 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
421 aa  338  9e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>