More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1476 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  84.47 
 
 		 219 aa  364  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  55 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  53.91 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  54.63 
 
 		 228 aa  244  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  55.26 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 224 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  50.89 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  51.57 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  52.68 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 226 aa  224  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.58 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  53.12 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 225 aa  216  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  51.54 
 
 		 229 aa  214  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1044  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00280  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.71 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  43.58 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.58 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  44.64 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.21 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 228 aa  188  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 236 aa  188  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.5 
 
 		 271 aa  187  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  44.44 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  43.12 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  44.09 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  45.21 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0095  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  44.09 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  44.44 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  44.19 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  44.44 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.2 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.58 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.58 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.04 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  40.36 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 223 aa  184  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.12 
 
 		 223 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>