More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1330 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  100 
 
 
130 aa  263  6e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  100 
 
 
116 aa  237  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  83.62 
 
 
116 aa  206  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  60.18 
 
 
127 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  60 
 
 
126 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.26248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  56.36 
 
 
118 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  56.36 
 
 
118 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  56.36 
 
 
118 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  54.87 
 
 
118 aa  140  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.32995e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  54.87 
 
 
118 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  54.87 
 
 
118 aa  140  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  54.87 
 
 
118 aa  140  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  56.36 
 
 
118 aa  139  1e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  56.36 
 
 
118 aa  139  1e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  53.98 
 
 
118 aa  139  1e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  53.1 
 
 
118 aa  137  4e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.6841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  49.11 
 
 
119 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 
131 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.45103e-05  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  44.25 
 
 
120 aa  117  4e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  45.95 
 
 
118 aa  117  5e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 
125 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  45.87 
 
 
122 aa  113  7e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  43.36 
 
 
119 aa  112  2e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.52845e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 
117 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
129 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 
141 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 
121 aa  109  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 
118 aa  107  4e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 
119 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 
124 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 
119 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 
119 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  43.36 
 
 
123 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  41.12 
 
 
138 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
147 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 
138 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  43.24 
 
 
117 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 
119 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 
122 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  40.19 
 
 
133 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 
118 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  42.02 
 
 
128 aa  100  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  40.87 
 
 
129 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 
130 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.64371e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  40 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  45.3 
 
 
117 aa  99  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  43.27 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 
126 aa  97.1  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  44.74 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 
171 aa  96.7  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  39.66 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 
129 aa  95.9  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
133 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  44.74 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  39.66 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 
121 aa  95.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  40.17 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  40.17 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  39.25 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 
132 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  35.34 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  40.17 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  42.11 
 
 
132 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 
136 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  39.42 
 
 
127 aa  93.6  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
122 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.70949e-12  hitchhiker  1.54001e-07 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  44.07 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  33.91 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 
133 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 
143 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.06496e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 
123 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4215  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 
133 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 
133 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 
133 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  42.61 
 
 
133 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>