More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1324 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  46.32 
 
 		 1367 aa  1094    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  45.74 
 
 		 1362 aa  1035    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  54.47 
 
 		 1210 aa  954    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  90.53 
 
 		 1436 aa  2729    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  72.82 
 
 		 483 aa  721    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  51.79 
 
 		 970 aa  1013    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  47.26 
 
 		 1527 aa  1127    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  49.15 
 
 		 1468 aa  1395    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  37.42 
 
 		 1438 aa  894    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  50.97 
 
 		 1443 aa  1459    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  59.14 
 
 		 1433 aa  1734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  59.07 
 
 		 1433 aa  1733    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  42.2 
 
 		 1493 aa  1010    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  59.14 
 
 		 1433 aa  1734    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  58.48 
 
 		 1435 aa  1731    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  58.93 
 
 		 1433 aa  1732    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  59.14 
 
 		 1433 aa  1734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  46.36 
 
 		 1367 aa  1098    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  47.53 
 
 		 1447 aa  1116    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  43.6 
 
 		 1479 aa  1042    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  52.29 
 
 		 1214 aa  916    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  48.36 
 
 		 1421 aa  1139    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  50.99 
 
 		 1407 aa  1274    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  38.73 
 
 		 1442 aa  866    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  59.14 
 
 		 1433 aa  1734    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  50.7 
 
 		 1397 aa  1243    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  46.39 
 
 		 1388 aa  1066    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  47.98 
 
 		 1449 aa  1254    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  47.35 
 
 		 1449 aa  1253    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1438 aa  2980    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  50.23 
 
 		 1440 aa  1319    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  58.85 
 
 		 1433 aa  1728    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  50.66 
 
 		 1212 aa  877    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  52.43 
 
 		 1635 aa  1328    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  43.93 
 
 		 1437 aa  1195    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  49.69 
 
 		 1432 aa  1425    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  46.84 
 
 		 1437 aa  1332    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  49.59 
 
 		 1464 aa  1406    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  46.84 
 
 		 1426 aa  1289    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  50.86 
 
 		 1433 aa  1295    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  46.49 
 
 		 1390 aa  1042    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  57.09 
 
 		 1444 aa  1676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  59 
 
 		 1433 aa  1732    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  51.57 
 
 		 1402 aa  1255    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  42.36 
 
 		 1465 aa  967    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1438 aa  2980    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  41.37 
 
 		 1365 aa  993    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  58.8 
 
 		 1433 aa  1727    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  46.84 
 
 		 1442 aa  1277    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  59.07 
 
 		 1433 aa  1733    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  40.25 
 
 		 989 aa  613  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24 
 
 		 1127 aa  181  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.62 
 
 		 1240 aa  180  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1148 aa  173  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  23.1 
 
 		 1176 aa  172  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  23.68 
 
 		 1165 aa  164  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  23.05 
 
 		 1167 aa  163  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.9 
 
 		 1181 aa  162  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.87 
 
 		 1157 aa  162  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  23.4 
 
 		 1155 aa  160  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.22 
 
 		 1148 aa  158  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  22.83 
 
 		 1156 aa  158  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.09 
 
 		 1139 aa  158  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  22.56 
 
 		 1184 aa  157  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.3 
 
 		 1170 aa  155  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  23.02 
 
 		 1156 aa  155  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.19 
 
 		 1130 aa  154  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  21.79 
 
 		 1155 aa  153  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  23.66 
 
 		 1180 aa  153  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  22.73 
 
 		 1454 aa  153  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  21.91 
 
 		 1179 aa  152  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  22.23 
 
 		 1145 aa  153  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  22.13 
 
 		 1170 aa  152  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.78 
 
 		 1165 aa  152  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  23.4 
 
 		 1476 aa  152  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  22.02 
 
 		 1170 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  22.51 
 
 		 1155 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.84 
 
 		 1134 aa  150  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.32 
 
 		 1132 aa  149  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  23.45 
 
 		 1139 aa  149  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  22.1 
 
 		 1122 aa  144  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0531  DNA polymerase III, alpha subunit  23.88 
 
 		 1205 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  22.46 
 
 		 1159 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  25.08 
 
 		 1607 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.99 
 
 		 1122 aa  143  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  23.43 
 
 		 1160 aa  142  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  23.24 
 
 		 1190 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  22.75 
 
 		 1510 aa  142  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  24.92 
 
 		 1174 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  22.65 
 
 		 1173 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.84 
 
 		 1153 aa  142  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  22.7 
 
 		 1225 aa  141  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  22.21 
 
 		 1485 aa  141  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  38.1 
 
 		 584 aa  141  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  22.1 
 
 		 1175 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  22.45 
 
 		 1172 aa  139  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  22.47 
 
 		 1159 aa  139  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  22.19 
 
 		 1173 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  23.21 
 
 		 1172 aa  138  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  22.88 
 
 		 1214 aa  138  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>