More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1296 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  73.38 
 
 
449 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  94.07 
 
 
455 aa  851    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  73.38 
 
 
449 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  73.15 
 
 
449 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  73.38 
 
 
449 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  73.38 
 
 
449 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  73.61 
 
 
449 aa  656    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  73.15 
 
 
449 aa  655    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  73.15 
 
 
449 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  72.92 
 
 
449 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  73.15 
 
 
449 aa  655    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  100 
 
 
455 aa  915    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  100 
 
 
455 aa  915    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  73.38 
 
 
449 aa  655    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  69.89 
 
 
446 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  71.29 
 
 
469 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.44 
 
 
481 aa  565  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  59.56 
 
 
479 aa  551  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  61.62 
 
 
446 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.07 
 
 
447 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  61.25 
 
 
449 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  61.43 
 
 
448 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.07 
 
 
446 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  62.5 
 
 
444 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  60.61 
 
 
453 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  58.24 
 
 
476 aa  530  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.17 
 
 
447 aa  527  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  63.44 
 
 
452 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  63.44 
 
 
452 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  55.36 
 
 
518 aa  518  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  61 
 
 
448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  61.15 
 
 
452 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.19 
 
 
491 aa  513  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  57.21 
 
 
445 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  58.6 
 
 
446 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  57.27 
 
 
492 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  55.66 
 
 
521 aa  503  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  56.39 
 
 
443 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  55.89 
 
 
520 aa  504  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  59.48 
 
 
445 aa  500  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.54 
 
 
507 aa  501  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  55.86 
 
 
451 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  56.58 
 
 
449 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  56.05 
 
 
450 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  55.92 
 
 
452 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.48 
 
 
452 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  56.43 
 
 
454 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  56.43 
 
 
454 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  56.28 
 
 
453 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  55.07 
 
 
518 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  54.06 
 
 
441 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  56.21 
 
 
449 aa  485  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  54.21 
 
 
443 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  54.18 
 
 
443 aa  483  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  54.16 
 
 
463 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  53.69 
 
 
444 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  53.09 
 
 
441 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  54.06 
 
 
444 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.27 
 
 
450 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  56.07 
 
 
454 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  54.36 
 
 
444 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  52.63 
 
 
442 aa  472  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  53.04 
 
 
512 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  53.3 
 
 
508 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  53.19 
 
 
493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.74 
 
 
512 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  55.92 
 
 
453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  55.45 
 
 
453 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.19 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  56.43 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  53 
 
 
450 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  52.89 
 
 
478 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  52.42 
 
 
451 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  53.83 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  51.52 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.11 
 
 
450 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  52.89 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  53.83 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.07 
 
 
457 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  51.01 
 
 
445 aa  455  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  50.33 
 
 
457 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  53.59 
 
 
442 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.58 
 
 
443 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  50.69 
 
 
462 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  51.32 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  51.16 
 
 
515 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  49.45 
 
 
455 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  49.67 
 
 
456 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  50.77 
 
 
457 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  48.79 
 
 
485 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  51.1 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  50.79 
 
 
463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.16 
 
 
511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  50.77 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  52.12 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  50.93 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  52.12 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  52.12 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  52.12 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  49.46 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>