244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1283 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  95.16 
 
 		 62 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  76.27 
 
 		 61 aa  95.9  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  77.97 
 
 		 61 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 		 62 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  69.35 
 
 		 62 aa  88.6  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  64.52 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  70.18 
 
 		 61 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  75 
 
 		 61 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  54.1 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  58.18 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  49.12 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0627  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00471545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  50.82 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11200  LSU ribosomal protein L28P  47.54 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00741345  normal  0.589072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1599  ribosomal protein L28  49.18 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2281  ribosomal protein L28  49.18 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.921868  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  53.85 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  50 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1676  ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000538501  hitchhiker  0.00422618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2306  ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000277359  hitchhiker  0.00207431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  43.1 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  49.15 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8027  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1343  LSU ribosomal protein L28P  40.98 
 
 		 63 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.754318  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  49.15 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3704  ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1846  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8002  LSU ribosomal protein L28P  45.9 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1508  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3439  ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1384  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.626686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2425  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00488373  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 63 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0821  ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0446  50S ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2515  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1705  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3287  50S ribosomal protein L28P  42.62 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0886721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0863  ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  normal  0.761868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1987  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  38.33 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf005  ribosomal protein L28  53.19 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0290  ribosomal protein L28  46.3 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1744  50S ribosomal protein L28  37.93 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000205787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0670  ribosomal protein L28  37.7 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000425645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3608  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3105  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00824796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0206  ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0160  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3959  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  37.7 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  37.7 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  40.32 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2199  ribosomal protein L28  36.21 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000434288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4389  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00781562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1367  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.23268  normal  0.35924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0072  ribosomal protein L28  34.43 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0514573  hitchhiker  0.000000000000135012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4099  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0864217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4115  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3927  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0253871  hitchhiker  0.00124431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3945  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00834113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4008  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4054  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0102  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000949516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>