More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1134 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1156  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
415 aa  853    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1134  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
415 aa  853    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0659  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.15 
 
 
413 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.80081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 
430 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
430 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
423 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.84 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.6 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.6 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 
423 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 
423 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 
423 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
423 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.79 
 
 
420 aa  367  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1601  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.3 
 
 
413 aa  360  2e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
422 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 
425 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 
422 aa  355  5.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 
423 aa  355  7.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 
421 aa  352  7e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 
424 aa  349  7e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
442 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
427 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.86 
 
 
429 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 
427 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
419 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.09 
 
 
704 aa  341  1e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.31 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  44.39 
 
 
429 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  44.39 
 
 
429 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
423 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.16 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.93 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.16 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.93 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.41 
 
 
416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.16 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.93 
 
 
429 aa  336  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.93 
 
 
429 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.43 
 
 
429 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.42 
 
 
430 aa  336  5.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.36 
 
 
432 aa  335  7.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 
428 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 
425 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
423 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
425 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
425 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
425 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
425 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
425 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
425 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
425 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
429 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
427 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 
429 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 
426 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 
419 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0700  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 
414 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 
429 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 
429 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
425 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.31 
 
 
426 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.43 
 
 
429 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 
429 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.31 
 
 
425 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.55 
 
 
426 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
427 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.78 
 
 
426 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.03 
 
 
423 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.45 
 
 
428 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
430 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 
428 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.31 
 
 
428 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 
428 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.8 
 
 
429 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.78 
 
 
426 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.22 
 
 
429 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.85 
 
 
426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.49 
 
 
429 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
425 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  42.82 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.29 
 
 
413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.27 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.75 
 
 
429 aa  326  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.37 
 
 
424 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.15 
 
 
427 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 
425 aa  325  6e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.22 
 
 
428 aa  325  7e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.92 
 
 
428 aa  325  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 
429 aa  325  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.84 
 
 
423 aa  325  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.79 
 
 
425 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>