More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1061 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  49.51 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  49.51 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  48.54 
 
 
251 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  47.98 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  40 
 
 
651 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  43.27 
 
 
1156 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  40 
 
 
651 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  42.71 
 
 
652 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  41 
 
 
656 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  38.83 
 
 
667 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  41.09 
 
 
668 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  40.59 
 
 
671 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  40.59 
 
 
669 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  42.37 
 
 
280 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  42.37 
 
 
280 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  43.93 
 
 
640 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  38.83 
 
 
381 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  34.95 
 
 
684 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  34.95 
 
 
684 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  40.56 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  34.95 
 
 
683 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  36.76 
 
 
227 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  39.45 
 
 
361 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  39.8 
 
 
197 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  33.5 
 
 
689 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  38.1 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  39.91 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  32.93 
 
 
230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  41.13 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  44.44 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  36.65 
 
 
674 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  33.04 
 
 
383 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  35.75 
 
 
387 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  41.46 
 
 
280 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 
282 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  40.85 
 
 
242 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  42.14 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  41.25 
 
 
280 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  35.37 
 
 
564 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  38.6 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  43.9 
 
 
688 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  36.52 
 
 
229 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  36.52 
 
 
229 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  35.67 
 
 
216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  38.6 
 
 
284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  41.46 
 
 
279 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  41.46 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  36.41 
 
 
244 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  38.46 
 
 
247 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  38.41 
 
 
179 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  37.43 
 
 
234 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  36.17 
 
 
281 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  37.44 
 
 
365 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  37.09 
 
 
641 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  32.86 
 
 
345 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  34.53 
 
 
684 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  38.65 
 
 
351 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  36.92 
 
 
620 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  35.12 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  37.66 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  36.21 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  35.56 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  34.64 
 
 
226 aa  95.9  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  37.2 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  36.47 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  32.35 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  35.12 
 
 
223 aa  89  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  31.98 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  28.25 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  39.63 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  39.63 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.25 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  32.33 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.25 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11730  protease subunit of ATP-dependent protease  32.9 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533928  normal  0.37296 
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.56 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  33.08 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4545  endopeptidase Clp  28.95 
 
 
216 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843015  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1568  Endopeptidase Clp  31.34 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463332  normal  0.0340848 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  34.07 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.08 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.93 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.14 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0872  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.83 
 
 
208 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.323505  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  30.6 
 
 
203 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.77 
 
 
194 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  30.6 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.77 
 
 
195 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.99 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.82 
 
 
211 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.77 
 
 
195 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.5 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0546  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.83 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0480  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.87 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0197  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.33 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  31.1 
 
 
400 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2184  endopeptidase Clp  28.57 
 
 
217 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.604475  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1830  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.33 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>