129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1060 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
412 aa  844    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
412 aa  844    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  47.78 
 
 
389 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  47 
 
 
404 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  47 
 
 
389 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  39.26 
 
 
264 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  28.43 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  29.65 
 
 
413 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  29.27 
 
 
409 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  26.9 
 
 
436 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  28.46 
 
 
415 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  28.2 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  27.86 
 
 
417 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  26.72 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  25.14 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  24.67 
 
 
412 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  25.63 
 
 
390 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  25.12 
 
 
425 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  25.12 
 
 
425 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  25.12 
 
 
425 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  26.24 
 
 
404 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  22.32 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  25.15 
 
 
426 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  25.65 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  24.62 
 
 
444 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  24.4 
 
 
421 aa  97.1  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  23.82 
 
 
409 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  24.05 
 
 
434 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  23.03 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  24.18 
 
 
432 aa  90.1  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  24.03 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  24.59 
 
 
544 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  20.94 
 
 
413 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  23.68 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  20.65 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  20.65 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  23.42 
 
 
434 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  21.37 
 
 
408 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  24.86 
 
 
434 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  23.67 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  22.84 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  21.92 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  24.59 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  21.74 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  21.64 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  25.36 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  23.31 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  23.31 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  20.53 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  24.82 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  22.49 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  21.19 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  21.45 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  20 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  22.75 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  22.13 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  22.78 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  23.62 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  28.47 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  22.85 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  19.79 
 
 
524 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.18 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.18 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  22.48 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  22.53 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  20.84 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3509  hypothetical protein  22.69 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  21.33 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3786  hypothetical protein  22.69 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  21.33 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  21.2 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  23.46 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  22.03 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  23.89 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  22.19 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  23.43 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  21.65 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  21.65 
 
 
455 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  21.11 
 
 
428 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3426  phage-related, head portal protein  21.9 
 
 
403 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  23.92 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  20.41 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  26.6 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5837  phage-related, head portal protein  22.16 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3430  HK97 family phage portal protein  21.84 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  21.26 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  22.76 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  22.73 
 
 
445 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  22.22 
 
 
445 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  22.65 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  21.16 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  20.87 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0444  phage-like  22.34 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  22.71 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  19.78 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  25.93 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  21.88 
 
 
833 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  21.88 
 
 
859 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  21.88 
 
 
833 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  20.05 
 
 
391 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>