More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0919 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
355 aa  732    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
355 aa  732    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.67 
 
 
363 aa  308  9e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.66 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  44.41 
 
 
363 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  44.29 
 
 
363 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  44.38 
 
 
364 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  44.17 
 
 
365 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  44.1 
 
 
364 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  44.1 
 
 
364 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  44.1 
 
 
364 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  44.1 
 
 
364 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  43.82 
 
 
364 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.45 
 
 
350 aa  285  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.68 
 
 
353 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.5 
 
 
354 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  42.52 
 
 
355 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  41.94 
 
 
350 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.44 
 
 
363 aa  245  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.19 
 
 
359 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.19 
 
 
359 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.89 
 
 
368 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.93 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.16 
 
 
359 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.69 
 
 
353 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.09 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.19 
 
 
359 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.69 
 
 
364 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.92 
 
 
366 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.14 
 
 
356 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.8 
 
 
360 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  39.71 
 
 
366 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  39.71 
 
 
366 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  39.71 
 
 
366 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.96 
 
 
358 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.94 
 
 
357 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  37.28 
 
 
359 aa  226  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.29 
 
 
365 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.31 
 
 
355 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  35.65 
 
 
359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.46 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.46 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.72 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.72 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.41 
 
 
353 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.74 
 
 
361 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.86 
 
 
354 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  39.23 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.43 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.3 
 
 
367 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2830  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.79 
 
 
360 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.79 
 
 
360 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0259  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.79 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.87 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.88 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  37 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.58 
 
 
361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.31 
 
 
349 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  37 
 
 
349 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.52 
 
 
381 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.62 
 
 
344 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  37 
 
 
349 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.52 
 
 
358 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.02 
 
 
346 aa  209  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.75 
 
 
351 aa  209  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.78 
 
 
354 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.91 
 
 
371 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.28 
 
 
366 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.07 
 
 
357 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  32.95 
 
 
358 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.98 
 
 
378 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.62 
 
 
350 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  35.84 
 
 
347 aa  204  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  35.23 
 
 
351 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  35.23 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  33.71 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.71 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.86 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.25 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.71 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.46 
 
 
358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.37 
 
 
350 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.39 
 
 
376 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  36.7 
 
 
356 aa  198  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.11 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  36.21 
 
 
350 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.8 
 
 
350 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.21 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  32.87 
 
 
361 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.89 
 
 
367 aa  195  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2419  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.39 
 
 
338 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.57961  normal  0.818937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0817  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.37 
 
 
356 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.87 
 
 
366 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.87 
 
 
361 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  36 
 
 
352 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.8 
 
 
351 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.4 
 
 
350 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2846  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.51 
 
 
349 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.98 
 
 
344 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.29 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>