More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0501 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  97.47 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  327  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  323  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  323  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  75.76 
 
 
198 aa  322  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  74.24 
 
 
198 aa  321  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  67.17 
 
 
198 aa  281  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  64.8 
 
 
199 aa  279  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  63.64 
 
 
198 aa  278  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  66.16 
 
 
198 aa  278  4e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  64.32 
 
 
199 aa  273  9e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  65.33 
 
 
200 aa  272  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  62.19 
 
 
213 aa  269  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  61.73 
 
 
199 aa  267  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  58.88 
 
 
199 aa  260  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  60.91 
 
 
198 aa  260  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  57.07 
 
 
199 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  57.36 
 
 
199 aa  249  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  58.25 
 
 
198 aa  246  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  58.25 
 
 
198 aa  246  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  56.63 
 
 
199 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  54.82 
 
 
200 aa  246  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  55.05 
 
 
200 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  56.77 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  57.14 
 
 
199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  58.55 
 
 
199 aa  241  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  52.79 
 
 
199 aa  240  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1409  recombination protein RecR  56.22 
 
 
201 aa  239  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.468928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  58.03 
 
 
199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  57.51 
 
 
199 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  55.1 
 
 
199 aa  237  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  54.08 
 
 
199 aa  235  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  54.08 
 
 
199 aa  234  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  52.53 
 
 
198 aa  234  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  56.35 
 
 
204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  55.73 
 
 
201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  52.85 
 
 
199 aa  230  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  52.82 
 
 
204 aa  228  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  52.55 
 
 
199 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  52.85 
 
 
199 aa  228  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  53.89 
 
 
199 aa  228  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  53.89 
 
 
204 aa  227  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  52.04 
 
 
199 aa  227  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  52.04 
 
 
202 aa  226  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  52.85 
 
 
199 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  48.99 
 
 
198 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  53.37 
 
 
199 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  53.06 
 
 
197 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  54.64 
 
 
202 aa  225  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  53.06 
 
 
197 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  52.55 
 
 
199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  49.49 
 
 
198 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  51.81 
 
 
202 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  53.47 
 
 
204 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  50.51 
 
 
199 aa  222  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  49.49 
 
 
198 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  49.49 
 
 
198 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  51 
 
 
205 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  52.33 
 
 
197 aa  221  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  51.53 
 
 
199 aa  221  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  49.49 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  54.97 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  53.85 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  52.79 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  53.54 
 
 
205 aa  218  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  52.33 
 
 
199 aa  217  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  52.08 
 
 
192 aa  216  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  47.69 
 
 
198 aa  217  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  51.49 
 
 
204 aa  216  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  50 
 
 
198 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  50.26 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  48.7 
 
 
219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  49.23 
 
 
198 aa  215  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  51.81 
 
 
197 aa  214  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  53.51 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  52.53 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  52.91 
 
 
189 aa  214  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  50.79 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  53.33 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  51.85 
 
 
189 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  49.74 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  50.26 
 
 
204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  49.24 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  51.53 
 
 
211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  52.51 
 
 
182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  49.48 
 
 
203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  50.26 
 
 
204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  52.75 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  46.97 
 
 
199 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>