More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0197 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0267  peptidoglycan hydrolase  41.48 
 
 
316 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578781  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0260  peptidoglycan hydrolase  41.48 
 
 
316 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  46.23 
 
 
507 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  43.59 
 
 
2066 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  43.59 
 
 
2066 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  38.97 
 
 
482 aa  85.1  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  39.1 
 
 
446 aa  84.3  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  38.52 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  37.31 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  37.31 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  37.31 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  37.31 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  38.06 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  37.31 
 
 
431 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  37.78 
 
 
419 aa  82  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  42.2 
 
 
424 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  40.71 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  38.33 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  39.62 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  44.04 
 
 
550 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  36.57 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  36.57 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  36.57 
 
 
431 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  42.98 
 
 
392 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  41.51 
 
 
423 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  39.47 
 
 
428 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.04 
 
 
503 aa  78.2  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  42.45 
 
 
438 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  35.37 
 
 
418 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  37.96 
 
 
321 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  39.81 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.8 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1402  peptidase M23B  46.74 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  42.31 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  40.71 
 
 
460 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  42.06 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  34.59 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  46.74 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  46.74 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  46.74 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  34.59 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  46.74 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  34.59 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35.07 
 
 
490 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  42.73 
 
 
449 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.34 
 
 
321 aa  74.7  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  41.51 
 
 
440 aa  74.7  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  40.48 
 
 
265 aa  74.7  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  33.56 
 
 
517 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  36.22 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3811  peptidase, M23/M37 family  33.96 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000746797  unclonable  9.38185e-26 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  37.04 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  43.4 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  37.19 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  35.71 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  41.59 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  41.12 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1604  M24/M37 family peptidase  45.65 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  41.12 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  41.12 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  41.12 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  42.11 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  41.12 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  38.58 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  39.62 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  39.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  39.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  34.35 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  39.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  39.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  39.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  38.28 
 
 
472 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  39.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  39.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  39.06 
 
 
462 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  39.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  40.57 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  39.25 
 
 
439 aa  72  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  43.16 
 
 
484 aa  72  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  41.07 
 
 
569 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  40.19 
 
 
438 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  41.12 
 
 
386 aa  72  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  41.12 
 
 
386 aa  72  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  40.19 
 
 
438 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  41.12 
 
 
386 aa  72  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  40.19 
 
 
410 aa  71.6  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  38.28 
 
 
429 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  35.25 
 
 
337 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  41.07 
 
 
241 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  37.9 
 
 
316 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  36.79 
 
 
486 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  36.43 
 
 
470 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.62 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  38.17 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  38.74 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  40 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  38.28 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  36.43 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>