More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0091 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  69.89 
 
 
463 aa  634    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  69.89 
 
 
463 aa  634    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  100 
 
 
462 aa  906    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  100 
 
 
462 aa  906    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  62.2 
 
 
466 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  59.4 
 
 
466 aa  541  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  59.4 
 
 
466 aa  541  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  54.68 
 
 
460 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  52.24 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0586  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 
495 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  46.07 
 
 
458 aa  430  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  47.92 
 
 
495 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  47.28 
 
 
491 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0582  major facilitator superfamily MFS_1  47.59 
 
 
495 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.19645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0265  major facilitator transporter  37.2 
 
 
458 aa  312  6.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0258  major facilitator transporter  37.2 
 
 
458 aa  312  6.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  28.71 
 
 
516 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0479  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
463 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 
522 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  29.66 
 
 
516 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  28.51 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  28.11 
 
 
500 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
574 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 
478 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  28.67 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 
488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.54 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.54 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 
504 aa  133  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  28.4 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.38 
 
 
493 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.77 
 
 
478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  27.96 
 
 
512 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  27.96 
 
 
512 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  27.61 
 
 
512 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  27.96 
 
 
512 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3656  major facilitator transporter  27.63 
 
 
515 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00788445  normal  0.022371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  29.14 
 
 
506 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 
541 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.38 
 
 
466 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 
478 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  27.75 
 
 
512 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.04 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
522 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  28.18 
 
 
497 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.37 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.28 
 
 
486 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  24.94 
 
 
582 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  28.4 
 
 
543 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 
519 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  24.32 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.71 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 
585 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  25.18 
 
 
582 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  25.18 
 
 
582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  26.73 
 
 
473 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  27.27 
 
 
470 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 
517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.94 
 
 
543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  25.31 
 
 
529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  25.55 
 
 
457 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0503  major facilitator superfamily permease  28.31 
 
 
568 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.737729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  26.4 
 
 
463 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  24.94 
 
 
582 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  24.83 
 
 
476 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 
474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 
516 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.35 
 
 
525 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  27.86 
 
 
489 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 
478 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
524 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.79 
 
 
477 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.35 
 
 
485 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.65 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  26.1 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.8 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.13 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8705  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.48 
 
 
579 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 
613 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.81 
 
 
521 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.61 
 
 
482 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.2 
 
 
502 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  28.42 
 
 
481 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
486 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
486 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  27.15 
 
 
460 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>