91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0056 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2353  hypothetical protein  99.33 
 
 
521 aa  601  1e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2491  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0056  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1254  hypothetical protein  93.67 
 
 
518 aa  573  1e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.111433  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1229  hypothetical protein  93.67 
 
 
518 aa  573  1e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.941876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2124  hypothetical protein  69.46 
 
 
517 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  65.02 
 
 
528 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313123  normal  0.0213036 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1836  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  66.33 
 
 
517 aa  397  1e-110  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00830  predicted membrane protein  60.33 
 
 
520 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04550  predicted membrane protein  62.12 
 
 
528 aa  361  7e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1054  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  47.9 
 
 
502 aa  265  6e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.544295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1242  putatve dicarboxylate transporter  47.9 
 
 
502 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0072618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1000  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  45.95 
 
 
497 aa  251  9e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0219424  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0553  C4-dicarboxylate anaerobic carrier dcuC  43.39 
 
 
512 aa  224  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69367e-19 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4645  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  44.6 
 
 
477 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2242  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  44.24 
 
 
478 aa  213  4e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.354885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0431  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  40.7 
 
 
482 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73068  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0449  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  38.65 
 
 
467 aa  199  4e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.935589  normal  0.0170379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1974  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  41.28 
 
 
468 aa  197  1e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1835  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  37.72 
 
 
492 aa  192  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4846  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  40.07 
 
 
467 aa  190  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4810  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  39.01 
 
 
467 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4747  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  39.01 
 
 
467 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4866  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  39.01 
 
 
467 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4716  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  39.01 
 
 
467 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  0.397486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1927  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.77 
 
 
508 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.0894208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.33 
 
 
461 aa  140  2e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.44962e-12  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.8 
 
 
477 aa  136  3e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1502  hypothetical protein  34.25 
 
 
520 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342277  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32.53 
 
 
464 aa  128  9e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.68 
 
 
460 aa  128  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.49 
 
 
505 aa  127  2e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  31.72 
 
 
500 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1545  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.32 
 
 
505 aa  123  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  28.06 
 
 
460 aa  121  1e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2707  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.73 
 
 
504 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2876  hypothetical protein  31.12 
 
 
513 aa  118  1e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1715  hypothetical protein  32.75 
 
 
513 aa  117  2e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2374  hypothetical protein  31.79 
 
 
492 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  29.03 
 
 
502 aa  113  4e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  28.67 
 
 
513 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.2139e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  29.09 
 
 
506 aa  111  2e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  2.57833e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  29.09 
 
 
492 aa  110  2e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  6.51661e-06  normal  0.856488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  29.09 
 
 
513 aa  111  2e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19916e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  29.09 
 
 
513 aa  110  2e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.68736e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  29.09 
 
 
513 aa  111  2e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.5044e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  29.09 
 
 
513 aa  110  2e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.69935e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1563  hypothetical protein  31.69 
 
 
522 aa  111  2e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.150626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.09 
 
 
492 aa  111  2e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.26812e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  29.09 
 
 
506 aa  111  2e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  2.47482e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1557  hypothetical protein  31.34 
 
 
522 aa  110  4e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.750418  normal  0.28282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1496  hypothetical protein  31.34 
 
 
522 aa  108  9e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  30.63 
 
 
481 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000044  membrane protein  29.03 
 
 
491 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  30.32 
 
 
506 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  30.32 
 
 
506 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  30.32 
 
 
506 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  30.32 
 
 
506 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  29.96 
 
 
506 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.96 
 
 
484 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  30.58 
 
 
481 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0990  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.65 
 
 
512 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2386  hypothetical protein  31.34 
 
 
509 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0184  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.35 
 
 
484 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2000  hypothetical protein  29.9 
 
 
481 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0420164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2339  hypothetical protein  29.58 
 
 
481 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00278972  normal  0.0466746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3322  putative transporter  28.63 
 
 
476 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.871023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  30.69 
 
 
514 aa  93.2  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1946  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32.34 
 
 
536 aa  92.4  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185929  normal  0.387022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1908  putative transporter  28.23 
 
 
476 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3342  putative transporter  27.76 
 
 
476 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00045821  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  28.79 
 
 
462 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.88544e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3048  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.74 
 
 
476 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0103079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3342  putative transporter  29.1 
 
 
476 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3328  transporter, putative  29.1 
 
 
476 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3369  transporter  29.1 
 
 
476 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3123  transporter  29.1 
 
 
476 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  8.66663e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3013  transporter  28.69 
 
 
476 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.89205e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.18 
 
 
477 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262721  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl015  arginine-ornithine APC transporter  25.9 
 
 
521 aa  80.1  5e-14  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2392  hypothetical protein  25.35 
 
 
484 aa  78.2  2e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0803  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.55 
 
 
588 aa  76.3  6e-13  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0398  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  26.53 
 
 
510 aa  75.9  9e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0496  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  26.53 
 
 
504 aa  75.5  1e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.774369  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1825  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  26.53 
 
 
520 aa  75.5  1e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2129  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  26.19 
 
 
495 aa  72  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.66 
 
 
464 aa  72  1e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0812  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  26.19 
 
 
492 aa  72  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  25.85 
 
 
470 aa  71.2  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0091  transporter, putative  24.92 
 
 
489 aa  68.9  1e-10  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0282  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.37 
 
 
496 aa  68.9  1e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>